Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J2E0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J2E0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J2E0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms