RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SGS1P35187 1447 aa16.97■□□□□ 0.31
PRP4YPR178W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PRP4YPR178W SSN2P38931 1420 aa16.53■□□□□ 0.24
PRP4YPR178W INO80P53115 1489 aa16.47■□□□□ 0.23
PRP4YPR178W DRS1P32892 752 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRP4YPR178W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRP4YPR178W TY1B-DR4Q07793 1604 aa15.58■□□□□ 0.08
PRP4YPR178W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PRP4YPR178W HSL1P34244 1518 aa15.49■□□□□ 0.07
PRP4YPR178W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PRP4YPR178W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PRP4YPR178W HIR3P47171 1648 aa15.25■□□□□ 0.03
PRP4YPR178W CHD1P32657 1468 aa15.22■□□□□ 0.03
PRP4YPR178W MMS22Q06164 1454 aa15.14■□□□□ 0.01
PRP4YPR178W REV3P14284 1504 aa15.1■□□□□ 0.01
PRP4YPR178W SIN3P22579 1536 aa15.05■□□□□ -0
PRP4YPR178W THO2P53552 1597 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRP4YPR178W SWR1Q05471 1514 aa14.99□□□□□ -0.01
PRP4YPR178W SSK2P53599 1579 aa14.96□□□□□ -0.01
PRP4YPR178W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRP4YPR178W TAF2P23255 1407 aa14.9□□□□□ -0.02
PRP4YPR178W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRP4YPR178W YTA7P40340 1379 aa14.82□□□□□ -0.04
PRP4YPR178W POL1P13382 1468 aa14.79□□□□□ -0.04
PRP4YPR178W STU1P38198 1513 aa14.78□□□□□ -0.04
PRP4YPR178W ESP1Q03018 1630 aa14.74□□□□□ -0.05
PRP4YPR178W UFD4P33202 1483 aa14.71□□□□□ -0.05
PRP4YPR178W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRP4YPR178W TRM732Q03496 1420 aa14.62□□□□□ -0.07
PRP4YPR178W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRP4YPR178W YPK9Q12697 1472 aa14.61□□□□□ -0.07
PRP4YPR178W BUD4P47136 1447 aa14.61□□□□□ -0.07
PRP4YPR178W ECM5Q03214 1411 aa14.58□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W BPT1P14772 1559 aa14.56□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W NOP2P40991 618 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data14.53□□□□□ -0.08not detected
PRP4YPR178W DNA2P38859 1522 aa14.53□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W MYO4P32492 1471 aa14.52□□□□□ -0.08
PRP4YPR178W TAF7Q05021 590 aa14.51□□□□□ -0.09
PRP4YPR178W YOR1P53049 1477 aa14.51□□□□□ -0.09
PRP4YPR178W SPP41P38904 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
PRP4YPR178W SCC2Q04002 1493 aa14.48□□□□□ -0.09
PRP4YPR178W ATG2P53855 1592 aa14.46□□□□□ -0.1
PRP4YPR178W RKR1Q04781 1562 aa14.44□□□□□ -0.1
PRP4YPR178W SMC4Q12267 1418 aa14.39□□□□□ -0.11
PRP4YPR178W RPO31P04051 1460 aa14.35□□□□□ -0.11
PRP4YPR178W NUP170P38181 1502 aa14.34□□□□□ -0.11
PRP4YPR178W STH1P32597 1359 aa14.34□□□□□ -0.11
PRP4YPR178W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PRP4YPR178W SSM4P40318 1319 aa14.33□□□□□ -0.12
PRP4YPR178W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRP4YPR178W KOG1P38873 1557 aa14.3□□□□□ -0.12
PRP4YPR178W PEP1P32319 1579 aa14.23□□□□□ -0.13
PRP4YPR178W POL5P39985 1022 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W ENP1P38333 483 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W IFH1P39520 1085 aa14.17□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W MDS3P53094 1487 aa14.16□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W PAN1P32521 1480 aa14.16□□□□□ -0.14
PRP4YPR178W TSC11P40061 1430 aa14.11□□□□□ -0.15
PRP4YPR178W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRP4YPR178W MLP2P40457 1679 aa14.05□□□□□ -0.16
PRP4YPR178W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W RTT106P40161 455 aa14.01□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY1B-DR3Q99231 1755 aa13.98□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-FP0CX63 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-CP25384 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-DR2Q03494 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY1B-DR1Q03855 1755 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-OR1Q12113 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-DR1Q12472 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W TY2B-OR2Q12501 1770 aa13.97□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W ULS1Q08562 1619 aa13.96□□□□□ -0.17
PRP4YPR178W SPT7P35177 1332 aa13.91□□□□□ -0.18
PRP4YPR178W VPS15P22219 1454 aa13.9□□□□□ -0.18
PRP4YPR178W TY3B-GQ99315 1547 aa13.89□□□□□ -0.19
PRP4YPR178W TY2B-BQ12491 1770 aa13.87□□□□□ -0.19
PRP4YPR178W SNT2P53127 1403 aa13.86□□□□□ -0.19
PRP4YPR178W VTH1P40438 1549 aa13.84□□□□□ -0.19
PRP4YPR178W VTH2P40890 1549 aa13.84□□□□□ -0.19
PRP4YPR178W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PRP4YPR178W CAT8P39113 1433 aa13.77□□□□□ -0.2
PRP4YPR178W PDR10P51533 1564 aa13.75□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-HO13535 1793 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-JR1P47098 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-ER1Q03612 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms