RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MTR4	YJL050W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MTR4	YJL050W	SSN2	P38931	1420 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTR4	YJL050W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MTR4	YJL050W	SGS1	P35187	1447 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTR4	YJL050W	INO80	P53115	1489 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MTR4	YJL050W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
MTR4	YJL050W	CHD1	P32657	1468 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MTR4	YJL050W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MTR4	YJL050W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MTR4	YJL050W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
MTR4	YJL050W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
MTR4	YJL050W	NUP170	P38181	1502 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTR4	YJL050W	MMS22	Q06164	1454 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTR4	YJL050W	UFD4	P33202	1483 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MTR4	YJL050W	FAP1	P53971	965 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTR4	YJL050W	SIN3	P22579	1536 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTR4	YJL050W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTR4	YJL050W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MTR4	YJL050W	HSL1	P34244	1518 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTR4	YJL050W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MTR4	YJL050W	SSK2	P53599	1579 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTR4	YJL050W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
MTR4	YJL050W	HIR3	P47171	1648 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	PRI1	P10363	409 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	STU1	P38198	1513 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	MLP2	P40457	1679 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	PEP1	P32319	1579 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	ESP1	Q03018	1630 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	SPP41	P38904	1435 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	REV3	P14284	1504 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTR4	YJL050W	TRM732	Q03496	1420 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTR4	YJL050W	POL1	P13382	1468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTR4	YJL050W	ECM5	Q03214	1411 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTR4	YJL050W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MTR4	YJL050W	STH1	P32597	1359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTR4	YJL050W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	AAD16	Q02895	342 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	MYO4	P32492	1471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	PRY3	P47033	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	YCK3	P39962	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTR4	YJL050W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	PDR10	P51533	1564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	BPT1	P14772	1559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	YOR1	P53049	1477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	DNA2	P38859	1522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	ATG2	P53855	1592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	YTA7	P40340	1379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	ISW2	Q08773	1120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR4	YJL050W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	YBT1	P32386	1661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	KOG1	P38873	1557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TAF7	Q05021	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	SRB8	P25648	1427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	SSM4	P40318	1319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	AVT3	P36062	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTR4	YJL050W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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