RNA–Protein interactions for RNA: YJL014W

CCT3, Transcript of Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex, yeastyeast

Gene CCT3, Length 1,605 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCT3YJL014W SGS1P35187 1447 aa11.32□□□□□ -0.6
CCT3YJL014W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCT3YJL014W SSN2P38931 1420 aa11.01□□□□□ -0.65
CCT3YJL014W INO80P53115 1489 aa10.93□□□□□ -0.66
CCT3YJL014W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CCT3YJL014W DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CCT3YJL014W TY1B-DR4Q07793 1604 aa10.6□□□□□ -0.71
CCT3YJL014W MTC1P47018 478 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CCT3YJL014W HSL1P34244 1518 aa10.48□□□□□ -0.73
CCT3YJL014W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CCT3YJL014W HIR3P47171 1648 aa10.32□□□□□ -0.76
CCT3YJL014W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CCT3YJL014W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CCT3YJL014W REV3P14284 1504 aa10.19□□□□□ -0.78
CCT3YJL014W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CCT3YJL014W THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CCT3YJL014W SWR1Q05471 1514 aa10.17□□□□□ -0.78
CCT3YJL014W SIN3P22579 1536 aa10.1□□□□□ -0.79
CCT3YJL014W SSK2P53599 1579 aa10.1□□□□□ -0.79
CCT3YJL014W TAF2P23255 1407 aa10.09□□□□□ -0.79
CCT3YJL014W MMS22Q06164 1454 aa10.08□□□□□ -0.8
CCT3YJL014W ESP1Q03018 1630 aa10.05□□□□□ -0.8
CCT3YJL014W CHD1P32657 1468 aa10.03□□□□□ -0.8
CCT3YJL014W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCT3YJL014W STU1P38198 1513 aa9.89□□□□□ -0.83
CCT3YJL014W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CCT3YJL014W BPT1P14772 1559 aa9.86□□□□□ -0.83
CCT3YJL014W POL1P13382 1468 aa9.86□□□□□ -0.83
CCT3YJL014W ATG2P53855 1592 aa9.84□□□□□ -0.83
CCT3YJL014W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CCT3YJL014W UFD4P33202 1483 aa9.78□□□□□ -0.84
CCT3YJL014W RKR1Q04781 1562 aa9.77□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W YPK9Q12697 1472 aa9.77□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W BUD4P47136 1447 aa9.77□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W YTA7P40340 1379 aa9.76□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W TRM732Q03496 1420 aa9.75□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W SCC2Q04002 1493 aa9.73□□□□□ -0.85
CCT3YJL014W DNA2P38859 1522 aa9.71□□□□□ -0.86
CCT3YJL014W KOG1P38873 1557 aa9.7□□□□□ -0.86
CCT3YJL014W YOR1P53049 1477 aa9.7□□□□□ -0.86
CCT3YJL014W ECM5Q03214 1411 aa9.68□□□□□ -0.86
CCT3YJL014W MYO4P32492 1471 aa9.65□□□□□ -0.86
CCT3YJL014W MLP2P40457 1679 aa9.64□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY1B-DR3Q99231 1755 aa9.64□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W PEP1P32319 1579 aa9.64□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-FP0CX63 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-CP25384 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-DR2Q03494 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY1B-DR1Q03855 1755 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-OR1Q12113 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-DR1Q12472 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W TY2B-OR2Q12501 1770 aa9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W RPO31P04051 1460 aa9.59□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W MDS3P53094 1487 aa9.59□□□□□ -0.87
CCT3YJL014W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.59□□□□□ -0.87not detected
CCT3YJL014W TY2B-BQ12491 1770 aa9.57□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W SMC4Q12267 1418 aa9.56□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W STH1P32597 1359 aa9.55□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W NUP170P38181 1502 aa9.54□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W SSM4P40318 1319 aa9.54□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCT3YJL014W SPP41P38904 1435 aa9.52□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W NOP2P40991 618 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W FAP1P53971 965 aa9.5□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W IFH1P39520 1085 aa9.49□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W ULS1Q08562 1619 aa9.49□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TAF7Q05021 590 aa9.49□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-HO13535 1793 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-JR1P47098 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-ER1Q03612 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-GR2Q12269 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-OLQ12273 1755 aa9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CCT3YJL014W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CCT3YJL014W TY1B-BRQ12193 1756 aa9.43□□□□□ -0.9
CCT3YJL014W TY1B-GR3Q12316 1755 aa9.43□□□□□ -0.9
CCT3YJL014W TY1B-ORQ92393 1755 aa9.43□□□□□ -0.9
CCT3YJL014W PAN1P32521 1480 aa9.41□□□□□ -0.9
CCT3YJL014W TSC11P40061 1430 aa9.39□□□□□ -0.91
CCT3YJL014W TY3B-GQ99315 1547 aa9.38□□□□□ -0.91
CCT3YJL014W YBT1P32386 1661 aa9.35□□□□□ -0.91
CCT3YJL014W RTT106P40161 455 aa9.33□□□□□ -0.92
CCT3YJL014W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CCT3YJL014W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24 ms