RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MTC1P47018 478 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
DDI1YER143W SGS1P35187 1447 aa16.61■□□□□ 0.25
DDI1YER143W INO80P53115 1489 aa16.42■□□□□ 0.22
DDI1YER143W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
DDI1YER143W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
DDI1YER143W DRS1P32892 752 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
DDI1YER143W TY1B-DR4Q07793 1604 aa16.24■□□□□ 0.19
DDI1YER143W FAP1P53971 965 aa16.21■□□□□ 0.19
DDI1YER143W SWR1Q05471 1514 aa15.95■□□□□ 0.14
DDI1YER143W HSL1P34244 1518 aa15.83■□□□□ 0.12
DDI1YER143W SSN2P38931 1420 aa15.75■□□□□ 0.11
DDI1YER143W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
DDI1YER143W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
DDI1YER143W DNA2P38859 1522 aa15.56■□□□□ 0.08
DDI1YER143W HIR3P47171 1648 aa15.51■□□□□ 0.07
DDI1YER143W KOG1P38873 1557 aa15.45■□□□□ 0.06
DDI1YER143W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
DDI1YER143W PRY3P47033 881 aa15.25■□□□□ 0.03
DDI1YER143W REV3P14284 1504 aa15.12■□□□□ 0.01
DDI1YER143W THO2P53552 1597 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
DDI1YER143W SIN3P22579 1536 aa15.06■□□□□ 0
DDI1YER143W BUD4P47136 1447 aa15.03■□□□□ -0
DDI1YER143W ECM5Q03214 1411 aa14.99□□□□□ -0.01
DDI1YER143W SSK2P53599 1579 aa14.94□□□□□ -0.02
DDI1YER143W ATG2P53855 1592 aa14.91□□□□□ -0.02
DDI1YER143W PEP1P32319 1579 aa14.85□□□□□ -0.03
DDI1YER143W MDS3P53094 1487 aa14.82□□□□□ -0.04
DDI1YER143W ESP1Q03018 1630 aa14.81□□□□□ -0.04
DDI1YER143W TAF2P23255 1407 aa14.81□□□□□ -0.04
DDI1YER143W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
DDI1YER143W AAD16Q02895 342 aa14.65□□□□□ -0.06
DDI1YER143W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDI1YER143W PRI1P10363 409 aa14.62□□□□□ -0.07
DDI1YER143W YPK9Q12697 1472 aa14.58□□□□□ -0.08
DDI1YER143W SCC2Q04002 1493 aa14.49□□□□□ -0.09
DDI1YER143W RPO31P04051 1460 aa14.41□□□□□ -0.1
DDI1YER143W POL1P13382 1468 aa14.41□□□□□ -0.1
DDI1YER143W ISW2Q08773 1120 aa14.39□□□□□ -0.11
DDI1YER143W UFD4P33202 1483 aa14.37□□□□□ -0.11
DDI1YER143W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
DDI1YER143W BPT1P14772 1559 aa14.34□□□□□ -0.11
DDI1YER143W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-FP0CX63 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-CP25384 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-DR2Q03494 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY1B-DR1Q03855 1755 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-OR1Q12113 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-DR1Q12472 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TY2B-OR2Q12501 1770 aa14.32□□□□□ -0.12
DDI1YER143W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
DDI1YER143W RKR1Q04781 1562 aa14.3□□□□□ -0.12
DDI1YER143W STU1P38198 1513 aa14.28□□□□□ -0.12
DDI1YER143W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
DDI1YER143W YCK3P39962 524 aa14.24□□□□□ -0.13
DDI1YER143W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
DDI1YER143W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
DDI1YER143W YOR1P53049 1477 aa14.22□□□□□ -0.13
DDI1YER143W RPG1P38249 964 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
DDI1YER143W TY1B-DR3Q99231 1755 aa14.21□□□□□ -0.13
DDI1YER143W TY2B-BQ12491 1770 aa14.17□□□□□ -0.14
DDI1YER143W TY1B-BRQ12193 1756 aa14.14□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-GR3Q12316 1755 aa14.14□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-ORQ92393 1755 aa14.14□□□□□ -0.15
DDI1YER143W SMC4Q12267 1418 aa14.14□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-HO13535 1793 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-JR1P47098 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-ER1Q03612 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-GR2Q12269 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-OLQ12273 1755 aa14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
DDI1YER143W CHD1P32657 1468 aa14.07□□□□□ -0.16
DDI1YER143W CDC25P04821 1589 aa14.07□□□□□ -0.16
DDI1YER143W YTA7P40340 1379 aa14.06□□□□□ -0.16
DDI1YER143W MYO4P32492 1471 aa14.03□□□□□ -0.16
DDI1YER143W MMS22Q06164 1454 aa13.98□□□□□ -0.17
DDI1YER143W PAN1P32521 1480 aa13.94□□□□□ -0.18
DDI1YER143W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
DDI1YER143W SPP41P38904 1435 aa13.91□□□□□ -0.18
DDI1YER143W DNF1P32660 1571 aa13.91□□□□□ -0.18
DDI1YER143W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-ER2Q03619 1755 aa13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-MR1Q04214 1755 aa13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-NL1Q12112 1755 aa13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-GR1Q12141 1755 aa13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W TY1B-BLQ12490 1755 aa13.85□□□□□ -0.19
DDI1YER143W VTH1P40438 1549 aa13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.1 ms