RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379378.7

E2F4-201, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F4, Length 2,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-201ENST00000379378 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
E2F4-201ENST00000379378 PBRM1Q86U86 1689 aa41.63■■■■■ 4.26
E2F4-201ENST00000379378 MAP3K1Q13233 1512 aa41.63■■■■■ 4.25
E2F4-201ENST00000379378 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.62■■■■■ 4.25
E2F4-201ENST00000379378 TIAM1Q13009 1591 aa41.6■■■■■ 4.25
E2F4-201ENST00000379378 P3H3Q8IVL6 736 aa41.58■■■■■ 4.25
E2F4-201ENST00000379378 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.58■■■■■ 4.25
E2F4-201ENST00000379378 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.57■■■■■ 4.242e-7■■■■■ 36.2
E2F4-201ENST00000379378 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
E2F4-201ENST00000379378 IFT140Q96RY7 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
E2F4-201ENST00000379378 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
E2F4-201ENST00000379378 ADAMTS12P58397 1594 aa41.45■■■■■ 4.23
E2F4-201ENST00000379378 ERCC6Q03468 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
E2F4-201ENST00000379378 SAMD9Q5K651 1589 aa41.44■■■■■ 4.23
E2F4-201ENST00000379378 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.44■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 GRIN2BQ13224 1484 aa41.43■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.41■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.38■■■■■ 4.22
E2F4-201ENST00000379378 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
E2F4-201ENST00000379378 FMN1Q68DA7 1419 aa41.33■■■■■ 4.21
E2F4-201ENST00000379378 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.3■■■■■ 4.2
E2F4-201ENST00000379378 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.28■■■■■ 4.2
E2F4-201ENST00000379378 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
E2F4-201ENST00000379378 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
E2F4-201ENST00000379378 IQGAP2Q13576 1575 aa41.19■■■■■ 4.18
E2F4-201ENST00000379378 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.15■■■■■ 4.18
E2F4-201ENST00000379378 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.06■■■■■ 4.16
E2F4-201ENST00000379378 GRIN2AQ12879 1464 aa40.99■■■■■ 4.15
E2F4-201ENST00000379378 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
E2F4-201ENST00000379378 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
E2F4-201ENST00000379378 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.94■■■■■ 4.14
E2F4-201ENST00000379378 ITGAEP38570 1179 aa40.91■■■■■ 4.14
E2F4-201ENST00000379378 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
E2F4-201ENST00000379378 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.86■■■■■ 4.13
E2F4-201ENST00000379378 SYNJ2O15056 1496 aa40.83■■■■■ 4.13
E2F4-201ENST00000379378 HECW1Q76N89 1606 aa40.82■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.8■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.79■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 DISP1Q96F81 1524 aa40.78■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 KIAA0556O60303 1618 aa40.78■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.77■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
E2F4-201ENST00000379378 CEP170Q5SW79 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.73■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.72■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 NCOA2Q15596 1464 aa40.72■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.7■■■■■ 4.11
E2F4-201ENST00000379378 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
E2F4-201ENST00000379378 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.65■■■■■ 4.1
E2F4-201ENST00000379378 ARHGEF11O15085 1522 aa40.63■■■■■ 4.09
E2F4-201ENST00000379378 NUP160Q12769 1436 aa40.62■■■■■ 4.09
E2F4-201ENST00000379378 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.61■■■■■ 4.09
E2F4-201ENST00000379378 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
E2F4-201ENST00000379378 FBLN2P98095 1184 aa40.58■■■■■ 4.09
E2F4-201ENST00000379378 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.48■■■■■ 4.07
E2F4-201ENST00000379378 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
E2F4-201ENST00000379378 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
E2F4-201ENST00000379378 MAPKBP1O60336 1514 aa40.43■■■■■ 4.06
E2F4-201ENST00000379378 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.43■■■■■ 4.06
E2F4-201ENST00000379378 ARID3CA6NKF2 412 aa40.42■■■■■ 4.06
E2F4-201ENST00000379378 PTPRKQ15262 1439 aa40.4■■■■■ 4.06
E2F4-201ENST00000379378 JPH4Q96JJ6 628 aa40.38■■■■■ 4.06
E2F4-201ENST00000379378 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
E2F4-201ENST00000379378 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
E2F4-201ENST00000379378 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
E2F4-201ENST00000379378 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.29■■■■■ 4.04
E2F4-201ENST00000379378 HFM1A2PYH4 1435 aa40.28■■■■■ 4.04
E2F4-201ENST00000379378 MIA2Q96PC5 1412 aa40.25■■■■■ 4.03
E2F4-201ENST00000379378 CHD1O14646 1710 aa40.17■■■■■ 4.02
E2F4-201ENST00000379378 NAIPQ13075 1403 aa40.17■■■■■ 4.02
E2F4-201ENST00000379378 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
E2F4-201ENST00000379378 ABCA8O94911 1581 aa40.11■■■■■ 4.01
E2F4-201ENST00000379378 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
E2F4-201ENST00000379378 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
E2F4-201ENST00000379378 UACAQ9BZF9 1416 aa40.02■■■■■ 4
E2F4-201ENST00000379378 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.01■■■■■ 4
E2F4-201ENST00000379378 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.01■■■■□ 3.99
E2F4-201ENST00000379378 AKNAQ7Z591 1439 aa40■■■■□ 3.99
E2F4-201ENST00000379378 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.98■■■■□ 3.99
E2F4-201ENST00000379378 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.96■■■■□ 3.99
E2F4-201ENST00000379378 KIF14Q15058 1648 aa39.96■■■■□ 3.99
E2F4-201ENST00000379378 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.93■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 SHROOM2Q13796 1616 aa39.93■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 ATP10BO94823 1461 aa39.92■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 DAPK1P53355 1430 aa39.9■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.89■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 PTPRGP23470 1445 aa39.89■■■■□ 3.98
E2F4-201ENST00000379378 NEUROD1Q13562 356 aa39.88■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 ABCC5O15440 1437 aa39.85■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 KDM6BO15054 1643 aa39.84■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.82■■■■□ 3.97
E2F4-201ENST00000379378 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.8■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms