RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C FBP26P32604 452 aa3.92□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C UTR2P32623 467 aa3.92□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C BDS1Q08347 646 aa3.92□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.92□□□□□ -1.78not detected
DOA4YDR069C MMS22Q06164 1454 aa3.92□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C IME2P32581 645 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C ASH1P34233 588 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C ISU1Q03020 165 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C YML083CQ04526 418 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C HDA3Q06623 655 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C MET32Q12041 191 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C TSC13Q99190 310 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C SPC110P32380 944 aa3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C PIL1P53252 339 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C YBL086CP38177 466 aa3.9□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C RTT106P40161 455 aa3.9□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C SRF1Q12516 437 aa3.9□□□□□ -1.78
DOA4YDR069C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C ACS2P52910 683 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C AFT1P22149 690 aa3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C VAN1P23642 535 aa3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C NTH2P35172 780 aa3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C GAS4Q08271 471 aa3.89□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C TRK1P12685 1235 aa3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C STE6P12866 1290 aa3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C VPS4P52917 437 aa3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C ARG82P07250 355 aa3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C SNU71P53207 620 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C WTM2Q12206 467 aa3.88□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C TOP1P04786 769 aa3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C RNA1P11745 407 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C CDC3P32457 520 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C GCR2Q01722 534 aa3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PET111P08468 800 aa3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C CWH41P53008 833 aa3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C ROM1P53046 1155 aa3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C TRS33Q99394 268 aa3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C CYT1P07143 309 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C SWI5P08153 709 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C SLX8P40072 274 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C YNL011CP53980 444 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PUN1Q06991 263 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C YJR115WP47152 169 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C IRC20Q06554 1556 aa3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C ALA1P40825 983 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C EAF7P53911 425 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C BYE1P36106 594 aa3.84□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C AAD14P42884 376 aa3.84□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C PSH1Q12161 406 aa3.84□□□□□ -1.79
DOA4YDR069C OPY1P38271 328 aa3.83□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C PAF1P38351 445 aa3.83□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SNF7P39929 240 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NUP170P38181 1502 aa3.83□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C MYO4P32492 1471 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C BRE2P43132 505 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NUP85P46673 744 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C MDG1P53885 366 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SRS2P12954 1174 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C DLD1P32891 587 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SUM1P46676 1062 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C LSC2P53312 427 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C PNP1Q05788 311 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C HAT1Q12341 374 aa3.82□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SRB8P25648 1427 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SMC3P47037 1230 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YLR346CQ06139 101 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C HIF1Q12373 385 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C UBP1P25037 809 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C KAR5Q04746 504 aa3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C THO2P53552 1597 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YPK9Q12697 1472 aa3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C RRN6P32786 894 aa3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C TLG1Q03322 224 aa3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YIR014WP40570 242 aa3.8□□□□□ -1.8
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