Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 YML009W-BYML009W-B 477 nt29.03■■■□□ 2.24
PAF1P38351 NSR1YGR159C 1245 nt28.6■■■□□ 2.17
PAF1P38351 NOP1YDL014W 984 nt28.35■■■□□ 2.13
PAF1P38351 YKL036CYKL036C 393 nt26.4■■□□□ 1.82
PAF1P38351 MDJ1YFL016C 1536 nt25.11■■□□□ 1.61
PAF1P38351 Q0297Q0297 156 nt24.88■■□□□ 1.57
PAF1P38351 SRX1YKL086W 384 nt24.75■■□□□ 1.55
PAF1P38351 YJL027CYJL027C 417 nt24.71■■□□□ 1.55
PAF1P38351 SCS3YGL126W 1143 nt24.14■■□□□ 1.45
PAF1P38351 YCR051WYCR051W 669 nt23.53■■□□□ 1.36
PAF1P38351 YOL085CYOL085C 342 nt22.84■■□□□ 1.25
PAF1P38351 PKP1YIL042C 1185 nt22.47■■□□□ 1.19
PAF1P38351 RPP1BYDL130W 321 nt22.33■■□□□ 1.17
PAF1P38351 DBP2YNL112W 1641 nt22.29■■□□□ 1.16
PAF1P38351 TRN1tP(UGG)A 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 SUF9tP(UGG)F 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 SUF8tP(UGG)H 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 SUF7tP(UGG)M 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 SUF11tP(UGG)O2 72 nt22.2■■□□□ 1.14
PAF1P38351 CCC1YLR220W 969 nt22.01■■□□□ 1.11
PAF1P38351 SCJ1YMR214W 1134 nt21.74■■□□□ 1.07
PAF1P38351 ATS1YAL020C 1002 nt21.68■■□□□ 1.06
PAF1P38351 YBR190WYBR190W 312 nt21.36■■□□□ 1.01
PAF1P38351 PET122YER153C 765 nt21.29■■□□□ 1
PAF1P38351 SCR1SCR1 522 nt21.18■□□□□ 0.98
PAF1P38351 RVS167YDR388W 1449 nt21.12■□□□□ 0.97
PAF1P38351 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt21.1■□□□□ 0.97
PAF1P38351 RTC3YHR087W 336 nt20.93■□□□□ 0.94
PAF1P38351 RRN5YLR141W 1092 nt20.72■□□□□ 0.91
PAF1P38351 YDJ1YNL064C 1230 nt20.42■□□□□ 0.86
PAF1P38351 SHR5YOL110W 714 nt20.41■□□□□ 0.86
PAF1P38351 RSB1YOR049C 1065 nt20.39■□□□□ 0.85
PAF1P38351 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.3■□□□□ 0.84
PAF1P38351 PST2YDR032C 597 nt20.02■□□□□ 0.8
PAF1P38351 GAR1YHR089C 618 nt19.93■□□□□ 0.78
PAF1P38351 DEP1YAL013W 1218 nt19.74■□□□□ 0.75
PAF1P38351 URN1YPR152C 1398 nt19.67■□□□□ 0.74
PAF1P38351 RPN10YHR200W 807 nt19.49■□□□□ 0.71
PAF1P38351 YNL208WYNL208W 600 nt19.48■□□□□ 0.71
PAF1P38351 YKL097CYKL097C 411 nt19.4■□□□□ 0.7
PAF1P38351 OPI9YLR338W 858 nt19.33■□□□□ 0.68
PAF1P38351 TIR1YER011W 765 nt19.24■□□□□ 0.67
PAF1P38351 SHU1YHL006C 453 nt19.14■□□□□ 0.65
PAF1P38351 PUT4YOR348C 1884 nt19.12■□□□□ 0.65
PAF1P38351 SAH1YER043C 1350 nt19.12■□□□□ 0.65
PAF1P38351 SSA1YAL005C 1929 nt18.92■□□□□ 0.62
PAF1P38351 ARE1YCR048W 1833 nt18.87■□□□□ 0.61
PAF1P38351 YJR018WYJR018W 363 nt18.79■□□□□ 0.6
PAF1P38351 PUN1YLR414C 792 nt18.79■□□□□ 0.6
PAF1P38351 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.77■□□□□ 0.6
PAF1P38351 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.66■□□□□ 0.58
PAF1P38351 SRB2YHR041C 633 nt18.62■□□□□ 0.57
PAF1P38351 POA1YBR022W 534 nt18.59■□□□□ 0.57
PAF1P38351 YOR139CYOR139C 393 nt18.53■□□□□ 0.56
PAF1P38351 RPP2BYDR382W 333 nt18.52■□□□□ 0.56
PAF1P38351 YJR120WYJR120W 351 nt18.5■□□□□ 0.55
PAF1P38351 PTC2YER089C 1395 nt18.49■□□□□ 0.55
PAF1P38351 YGR021WYGR021W 873 nt18.44■□□□□ 0.54
PAF1P38351 WWM1YFL010C 636 nt18.43■□□□□ 0.54
PAF1P38351 NPL3YDR432W 1245 nt18.37■□□□□ 0.53
PAF1P38351 HOM6YJR139C 1080 nt18.35■□□□□ 0.53
PAF1P38351 MNP1YGL068W 585 nt18.3■□□□□ 0.52
PAF1P38351 BUD23YCR047C 828 nt18.29■□□□□ 0.52
PAF1P38351 NAB2YGL122C 1578 nt18.21■□□□□ 0.51
PAF1P38351 BDH2YAL061W 1254 nt18.17■□□□□ 0.5
PAF1P38351 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt18.15■□□□□ 0.5
PAF1P38351 YOL037CYOL037C 354 nt18.14■□□□□ 0.49
PAF1P38351 BSC6YOL137W 1494 nt18.12■□□□□ 0.49
PAF1P38351 INM2YDR287W 879 nt18.1■□□□□ 0.49
PAF1P38351 RKM5YLR137W 1104 nt18.09■□□□□ 0.49
PAF1P38351 DAL1YIR027C 1383 nt18.04■□□□□ 0.48
PAF1P38351 FPR4YLR449W 1179 nt18.03■□□□□ 0.48
PAF1P38351 SSA3YBL075C 1950 nt18.02■□□□□ 0.47
PAF1P38351 LSM3YLR438C-A 270 nt17.99■□□□□ 0.47
PAF1P38351 YBL100CYBL100C 315 nt17.96■□□□□ 0.47
PAF1P38351 FIS1YIL065C 468 nt17.95■□□□□ 0.46
PAF1P38351 PHO4YFR034C 939 nt17.84■□□□□ 0.45
PAF1P38351 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 TRM9YML014W 840 nt17.8■□□□□ 0.44
PAF1P38351 FUN26YAL022C 1554 nt17.74■□□□□ 0.43
PAF1P38351 YLR281CYLR281C 468 nt17.67■□□□□ 0.42
PAF1P38351 PUS2YGL063W 1113 nt17.62■□□□□ 0.41
PAF1P38351 WHI5YOR083W 888 nt17.59■□□□□ 0.41
PAF1P38351 CCT6YDR188W 1641 nt17.56■□□□□ 0.4
PAF1P38351 ALF1YNL148C 765 nt17.48■□□□□ 0.39
PAF1P38351 SUF2tP(AGG)C 72 nt17.44■□□□□ 0.38
PAF1P38351 SUF10tP(AGG)N 72 nt17.44■□□□□ 0.38
PAF1P38351 YPS1YLR120C 1710 nt17.38■□□□□ 0.37
PAF1P38351 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.36■□□□□ 0.37
PAF1P38351 YDR095CYDR095C 411 nt17.33■□□□□ 0.36
PAF1P38351 DSK2YMR276W 1122 nt17.26■□□□□ 0.35
PAF1P38351 IMP2'YIL154C 1041 nt17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms