Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.46■■□□□ 1.83
UBP1P25037 NOP1YDL014W 984 nt26.15■■□□□ 1.78
UBP1P25037 NSR1YGR159C 1245 nt25.52■■□□□ 1.68
UBP1P25037 YKL036CYKL036C 393 nt24.92■■□□□ 1.58
UBP1P25037 YJL027CYJL027C 417 nt23.43■■□□□ 1.34
UBP1P25037 Q0297Q0297 156 nt23.12■■□□□ 1.29
UBP1P25037 SCS3YGL126W 1143 nt23.08■■□□□ 1.29
UBP1P25037 SRX1YKL086W 384 nt22.79■■□□□ 1.24
UBP1P25037 MDJ1YFL016C 1536 nt21.75■■□□□ 1.07
UBP1P25037 YCR051WYCR051W 669 nt21.71■■□□□ 1.07
UBP1P25037 SCJ1YMR214W 1134 nt21.66■■□□□ 1.06
UBP1P25037 YOL085CYOL085C 342 nt21.51■■□□□ 1.03
UBP1P25037 PKP1YIL042C 1185 nt21.05■□□□□ 0.96
UBP1P25037 ATS1YAL020C 1002 nt20.9■□□□□ 0.94
UBP1P25037 RPP1BYDL130W 321 nt20.75■□□□□ 0.91
UBP1P25037 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.06■□□□□ 0.8
UBP1P25037 CCC1YLR220W 969 nt19.86■□□□□ 0.77
UBP1P25037 SCR1SCR1 522 nt19.82■□□□□ 0.76
UBP1P25037 PET122YER153C 765 nt19.68■□□□□ 0.74
UBP1P25037 RTC3YHR087W 336 nt19.61■□□□□ 0.73
UBP1P25037 DBP2YNL112W 1641 nt19.55■□□□□ 0.72
UBP1P25037 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.28■□□□□ 0.68
UBP1P25037 RRN5YLR141W 1092 nt19.21■□□□□ 0.67
UBP1P25037 PST2YDR032C 597 nt19.18■□□□□ 0.66
UBP1P25037 RSB1YOR049C 1065 nt19.13■□□□□ 0.65
UBP1P25037 YKL097CYKL097C 411 nt18.97■□□□□ 0.63
UBP1P25037 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.83■□□□□ 0.6
UBP1P25037 RVS167YDR388W 1449 nt18.77■□□□□ 0.6
UBP1P25037 YDJ1YNL064C 1230 nt18.67■□□□□ 0.58
UBP1P25037 YBR190WYBR190W 312 nt18.37■□□□□ 0.53
UBP1P25037 SHR5YOL110W 714 nt18.27■□□□□ 0.52
UBP1P25037 SHU1YHL006C 453 nt18.18■□□□□ 0.5
UBP1P25037 GAR1YHR089C 618 nt18.08■□□□□ 0.48
UBP1P25037 YOR139CYOR139C 393 nt17.94■□□□□ 0.46
UBP1P25037 NPL3YDR432W 1245 nt17.72■□□□□ 0.43
UBP1P25037 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.6■□□□□ 0.41
UBP1P25037 TIR1YER011W 765 nt17.45■□□□□ 0.38
UBP1P25037 DEP1YAL013W 1218 nt17.39■□□□□ 0.37
UBP1P25037 YNL208WYNL208W 600 nt17.29■□□□□ 0.36
UBP1P25037 RPN10YHR200W 807 nt17.24■□□□□ 0.35
UBP1P25037 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.19■□□□□ 0.34
UBP1P25037 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.19■□□□□ 0.34
UBP1P25037 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.19■□□□□ 0.34
UBP1P25037 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.19■□□□□ 0.34
UBP1P25037 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.19■□□□□ 0.34
UBP1P25037 URN1YPR152C 1398 nt17.18■□□□□ 0.34
UBP1P25037 YOL037CYOL037C 354 nt17.18■□□□□ 0.34
UBP1P25037 BSC6YOL137W 1494 nt17.1■□□□□ 0.33
UBP1P25037 YGR021WYGR021W 873 nt17.07■□□□□ 0.32
UBP1P25037 MNP1YGL068W 585 nt17■□□□□ 0.31
UBP1P25037 SSA1YAL005C 1929 nt16.98■□□□□ 0.31
UBP1P25037 HOM6YJR139C 1080 nt16.97■□□□□ 0.31
UBP1P25037 MOT3YMR070W 1473 nt16.92■□□□□ 0.3
UBP1P25037 WWM1YFL010C 636 nt16.79■□□□□ 0.28
UBP1P25037 SRB2YHR041C 633 nt16.78■□□□□ 0.28
UBP1P25037 PUS2YGL063W 1113 nt16.77■□□□□ 0.28
UBP1P25037 OPI9YLR338W 858 nt16.76■□□□□ 0.27
UBP1P25037 RKM5YLR137W 1104 nt16.74■□□□□ 0.27
UBP1P25037 MRPL8YJL063C 717 nt16.65■□□□□ 0.26
UBP1P25037 YLR281CYLR281C 468 nt16.63■□□□□ 0.25
UBP1P25037 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.58■□□□□ 0.24
UBP1P25037 YJR018WYJR018W 363 nt16.47■□□□□ 0.23
UBP1P25037 RPP2BYDR382W 333 nt16.45■□□□□ 0.22
UBP1P25037 WHI5YOR083W 888 nt16.45■□□□□ 0.22
UBP1P25037 SAH1YER043C 1350 nt16.37■□□□□ 0.21
UBP1P25037 FMP45YDL222C 930 nt16.36■□□□□ 0.21
UBP1P25037 ADO1YJR105W 1023 nt16.35■□□□□ 0.21
UBP1P25037 PUN1YLR414C 792 nt16.33■□□□□ 0.2
UBP1P25037 UBX6YJL048C 1191 nt16.29■□□□□ 0.2
UBP1P25037 YJR120WYJR120W 351 nt16.29■□□□□ 0.2
UBP1P25037 YCH1YGR203W 447 nt16.28■□□□□ 0.2
UBP1P25037 DSK2YMR276W 1122 nt16.23■□□□□ 0.19
UBP1P25037 BDH2YAL061W 1254 nt16.21■□□□□ 0.19
UBP1P25037 IMP2'YIL154C 1041 nt16.19■□□□□ 0.18
UBP1P25037 LSM3YLR438C-A 270 nt16.19■□□□□ 0.18
UBP1P25037 SSA3YBL075C 1950 nt16.15■□□□□ 0.18
UBP1P25037 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.12■□□□□ 0.17
UBP1P25037 YEL076CYEL076C 651 nt16.12■□□□□ 0.17
UBP1P25037 YLR464WYLR464W 651 nt16.12■□□□□ 0.17
UBP1P25037 YPR011CYPR011C 981 nt16.11■□□□□ 0.17
UBP1P25037 YLR236CYLR236C 324 nt16.06■□□□□ 0.16
UBP1P25037 PTC2YER089C 1395 nt15.9■□□□□ 0.14
UBP1P25037 PUT4YOR348C 1884 nt15.9■□□□□ 0.14
UBP1P25037 SIS1YNL007C 1059 nt15.89■□□□□ 0.13
UBP1P25037 ARE1YCR048W 1833 nt15.89■□□□□ 0.13
UBP1P25037 RTG1YOL067C 534 nt15.87■□□□□ 0.13
UBP1P25037 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.84■□□□□ 0.13
UBP1P25037 INM2YDR287W 879 nt15.8■□□□□ 0.12
UBP1P25037 YDR094WYDR094W 336 nt15.77■□□□□ 0.12
UBP1P25037 TRM9YML014W 840 nt15.77■□□□□ 0.12
UBP1P25037 YBL100CYBL100C 315 nt15.77■□□□□ 0.12
UBP1P25037 SPP1YPL138C 1062 nt15.76■□□□□ 0.11
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