RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DOA4YDR069C MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
DOA4YDR069C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
DOA4YDR069C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
DOA4YDR069C AVT3P36062 692 aa6.38□□□□□ -1.39
DOA4YDR069C FAP1P53971 965 aa6.34□□□□□ -1.39
DOA4YDR069C ISW2Q08773 1120 aa6.24□□□□□ -1.41
DOA4YDR069C TFA1P36100 482 aa6.19□□□□□ -1.42
DOA4YDR069C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
DOA4YDR069C RPG1P38249 964 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
DOA4YDR069C PRI1P10363 409 aa6.11□□□□□ -1.43
DOA4YDR069C AAD16Q02895 342 aa6.05□□□□□ -1.44
DOA4YDR069C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
DOA4YDR069C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
DOA4YDR069C PRY3P47033 881 aa5.91□□□□□ -1.46
DOA4YDR069C REB1P21538 810 aa5.9□□□□□ -1.46
DOA4YDR069C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
DOA4YDR069C MRPL32P25348 183 aa5.65□□□□□ -1.51
DOA4YDR069C SPT21P35209 758 aa5.65□□□□□ -1.51
DOA4YDR069C RIM101P33400 625 aa5.59□□□□□ -1.51
DOA4YDR069C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
DOA4YDR069C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
DOA4YDR069C YCK3P39962 524 aa5.46□□□□□ -1.53
DOA4YDR069C PTP3P40048 928 aa5.46□□□□□ -1.53
DOA4YDR069C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
DOA4YDR069C HOP09932 586 aa5.42□□□□□ -1.54
DOA4YDR069C OXP1P28273 1286 aa5.42□□□□□ -1.54
DOA4YDR069C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
DOA4YDR069C TFC8Q12308 588 aa5.39□□□□□ -1.55
DOA4YDR069C CDC27P38042 758 aa5.38□□□□□ -1.55
DOA4YDR069C SSP1P38871 571 aa5.38□□□□□ -1.55
DOA4YDR069C DCD1P06773 312 aa5.36□□□□□ -1.55
DOA4YDR069C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
DOA4YDR069C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.33□□□□□ -1.56not detected
DOA4YDR069C RSM7P47150 247 aa5.3□□□□□ -1.56
DOA4YDR069C YLR271WQ06152 274 aa5.27□□□□□ -1.57
DOA4YDR069C YGL015CP33199 130 aa5.25□□□□□ -1.57
DOA4YDR069C BCH2P36122 765 aa5.24□□□□□ -1.57
DOA4YDR069C BBC1P47068 1157 aa5.21□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C AI2P03876 854 aa5.2□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C SCY1P53009 804 aa5.19□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C MGA2P40578 1113 aa5.18□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C MAP2P38174 421 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C EPS1P40557 701 aa5.16□□□□□ -1.58
DOA4YDR069C DMA1P38823 416 aa5.13□□□□□ -1.59
DOA4YDR069C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
DOA4YDR069C CST9Q06032 482 aa5.11□□□□□ -1.59
DOA4YDR069C BDF1P35817 686 aa5.11□□□□□ -1.59
DOA4YDR069C SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
DOA4YDR069C MRM1P25270 412 aa5.05□□□□□ -1.6
DOA4YDR069C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
DOA4YDR069C RTG3P38165 486 aa4.98□□□□□ -1.61
DOA4YDR069C TGL3P40308 642 aa4.93□□□□□ -1.62
DOA4YDR069C RCR1P38212 213 aa4.93□□□□□ -1.62
DOA4YDR069C RAM2P29703 316 aa4.93□□□□□ -1.62
DOA4YDR069C VPS29P38759 282 aa4.89□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data4.88□□□□□ -1.63not detected
DOA4YDR069C YAP5P40574 245 aa4.87□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C YOR238WQ08634 303 aa4.87□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C DBP1P24784 617 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C YFR006WP43590 535 aa4.86□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.84□□□□□ -1.63not detected
DOA4YDR069C PIB1Q06651 286 aa4.84□□□□□ -1.63
DOA4YDR069C MIF2P35201 549 aa4.83□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C STS1P38637 319 aa4.82□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C COQ8P27697 501 aa4.8□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C GTT3P39996 337 aa4.8□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C IFH1P39520 1085 aa4.79□□□□□ -1.64
DOA4YDR069C VPS70P47161 811 aa4.77□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C MST1P07236 462 aa4.75□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C EDS1P38073 919 aa4.74□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C CKB1P43639 278 aa4.73□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C YPR148CQ06523 435 aa4.72□□□□□ -1.65
DOA4YDR069C ATH1P48016 1211 aa4.71□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C WSC3Q12215 556 aa4.7□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C GYP5Q12344 894 aa4.7□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C UBP9P39967 754 aa4.68□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C SAM3Q08986 587 aa4.68□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C SET4P42948 560 aa4.67□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C GUT1P32190 709 aa4.67□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C YOL036WQ08206 761 aa4.66□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C DCW1P36091 449 aa4.65□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
DOA4YDR069C LEU3P08638 886 aa4.65□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C PBS2P08018 668 aa4.64□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C ABP1P15891 592 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C MSB4Q12317 492 aa4.64□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C YBL029C-AQ3E756 94 aa4.63□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C HTA1P04911 132 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C HTA2P04912 132 aa4.62□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C EAP1P36041 632 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms