Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

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Length 944 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 NSR1YGR159C 1245 nt22.05■■□□□ 1.12
SPC110P32380 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.79■■□□□ 1.08
SPC110P32380 NOP1YDL014W 984 nt21.03■□□□□ 0.96
SPC110P32380 MDJ1YFL016C 1536 nt20.02■□□□□ 0.8
SPC110P32380 YKL036CYKL036C 393 nt19.03■□□□□ 0.64
SPC110P32380 YJL027CYJL027C 417 nt18.49■□□□□ 0.55
SPC110P32380 SRX1YKL086W 384 nt18.3■□□□□ 0.52
SPC110P32380 Q0297Q0297 156 nt18.16■□□□□ 0.5
SPC110P32380 DBP2YNL112W 1641 nt17.43■□□□□ 0.38
SPC110P32380 YCR051WYCR051W 669 nt17.38■□□□□ 0.37
SPC110P32380 SCS3YGL126W 1143 nt17.24■□□□□ 0.35
SPC110P32380 YBR190WYBR190W 312 nt17.22■□□□□ 0.35
SPC110P32380 SSA3YBL075C 1950 nt17.22■□□□□ 0.35
SPC110P32380 RTC3YHR087W 336 nt16.88■□□□□ 0.29
SPC110P32380 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SPC110P32380 CCC1YLR220W 969 nt16.71■□□□□ 0.27
SPC110P32380 YOL085CYOL085C 342 nt16.45■□□□□ 0.22
SPC110P32380 RVS167YDR388W 1449 nt16.45■□□□□ 0.22
SPC110P32380 RPP1BYDL130W 321 nt16.32■□□□□ 0.2
SPC110P32380 PKP1YIL042C 1185 nt16.2■□□□□ 0.18
SPC110P32380 SCJ1YMR214W 1134 nt16.13■□□□□ 0.17
SPC110P32380 PUT4YOR348C 1884 nt15.94■□□□□ 0.14
SPC110P32380 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.77■□□□□ 0.12
SPC110P32380 SHR5YOL110W 714 nt15.7■□□□□ 0.1
SPC110P32380 PET122YER153C 765 nt15.63■□□□□ 0.09
SPC110P32380 URN1YPR152C 1398 nt15.57■□□□□ 0.08
SPC110P32380 ARE1YCR048W 1833 nt15.5■□□□□ 0.07
SPC110P32380 POA1YBR022W 534 nt15.47■□□□□ 0.07
SPC110P32380 SAH1YER043C 1350 nt15.45■□□□□ 0.06
SPC110P32380 DEP1YAL013W 1218 nt15.43■□□□□ 0.06
SPC110P32380 ATS1YAL020C 1002 nt15.42■□□□□ 0.06
SPC110P32380 OPI9YLR338W 858 nt15.42■□□□□ 0.06
SPC110P32380 SCR1SCR1 522 nt15.42■□□□□ 0.06
SPC110P32380 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.37■□□□□ 0.05
SPC110P32380 RPN10YHR200W 807 nt15.29■□□□□ 0.04
SPC110P32380 YDJ1YNL064C 1230 nt15.25■□□□□ 0.03
SPC110P32380 BSC6YOL137W 1494 nt15.2■□□□□ 0.02
SPC110P32380 YNL208WYNL208W 600 nt15.15■□□□□ 0.02
SPC110P32380 RRN5YLR141W 1092 nt15.14■□□□□ 0.01
SPC110P32380 BUD23YCR047C 828 nt15.03■□□□□ -0
SPC110P32380 GAR1YHR089C 618 nt15.02■□□□□ -0
SPC110P32380 PUN1YLR414C 792 nt15.01□□□□□ -0.01
SPC110P32380 PTC2YER089C 1395 nt14.89□□□□□ -0.03
SPC110P32380 YJR018WYJR018W 363 nt14.83□□□□□ -0.04
SPC110P32380 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.82□□□□□ -0.04
SPC110P32380 NAB2YGL122C 1578 nt14.77□□□□□ -0.05
SPC110P32380 RSB1YOR049C 1065 nt14.74□□□□□ -0.05
SPC110P32380 SPT5YML010W 3192 nt14.67□□□□□ -0.06
SPC110P32380 SSA4YER103W 1929 nt14.65□□□□□ -0.06
SPC110P32380 PAC11YDR488C 1602 nt14.58□□□□□ -0.08
SPC110P32380 TIR1YER011W 765 nt14.52□□□□□ -0.09
SPC110P32380 FPR4YLR449W 1179 nt14.5□□□□□ -0.09
SPC110P32380 DAL1YIR027C 1383 nt14.47□□□□□ -0.09
SPC110P32380 RPP2BYDR382W 333 nt14.46□□□□□ -0.09
SPC110P32380 FIS1YIL065C 468 nt14.45□□□□□ -0.1
SPC110P32380 NVJ2YPR091C 2313 nt14.41□□□□□ -0.1
SPC110P32380 SSA1YAL005C 1929 nt14.4□□□□□ -0.1
SPC110P32380 INM2YDR287W 879 nt14.38□□□□□ -0.11
SPC110P32380 YJR120WYJR120W 351 nt14.38□□□□□ -0.11
SPC110P32380 PHO4YFR034C 939 nt14.33□□□□□ -0.12
SPC110P32380 MEP2YNL142W 1500 nt14.31□□□□□ -0.12
SPC110P32380 PST2YDR032C 597 nt14.29□□□□□ -0.12
SPC110P32380 BDF1YLR399C 2061 nt14.27□□□□□ -0.12
SPC110P32380 YPS1YLR120C 1710 nt14.19□□□□□ -0.14
SPC110P32380 YBL100CYBL100C 315 nt14.16□□□□□ -0.14
SPC110P32380 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.15□□□□□ -0.14
SPC110P32380 DCW1YKL046C 1350 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC110P32380 FPS1YLL043W 2010 nt14.05□□□□□ -0.16
SPC110P32380 TAT1YBR069C 1860 nt14.04□□□□□ -0.16
SPC110P32380 YDR095CYDR095C 411 nt14.03□□□□□ -0.16
SPC110P32380 BDH2YAL061W 1254 nt14.01□□□□□ -0.17
SPC110P32380 SRB2YHR041C 633 nt14□□□□□ -0.17
SPC110P32380 FUN26YAL022C 1554 nt13.96□□□□□ -0.18
SPC110P32380 YMR090WYMR090W 684 nt13.93□□□□□ -0.18
SPC110P32380 ALF1YNL148C 765 nt13.93□□□□□ -0.18
SPC110P32380 EMI2YDR516C 1503 nt13.9□□□□□ -0.18
SPC110P32380 TRM9YML014W 840 nt13.88□□□□□ -0.19
SPC110P32380 RPP2AYOL039W 321 nt13.8□□□□□ -0.2
SPC110P32380 WWM1YFL010C 636 nt13.79□□□□□ -0.2
SPC110P32380 YBR220CYBR220C 1683 nt13.76□□□□□ -0.21
SPC110P32380 YDL221WYDL221W 552 nt13.76□□□□□ -0.21
SPC110P32380 LSM3YLR438C-A 270 nt13.76□□□□□ -0.21
SPC110P32380 PTP1YDL230W 1008 nt13.72□□□□□ -0.21
SPC110P32380 YKL097CYKL097C 411 nt13.72□□□□□ -0.21
SPC110P32380 CAC2YML102W 1407 nt13.71□□□□□ -0.22
SPC110P32380 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SPC110P32380 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SPC110P32380 SHU1YHL006C 453 nt13.7□□□□□ -0.22
SPC110P32380 CCT6YDR188W 1641 nt13.7□□□□□ -0.22
SPC110P32380 SDH1YKL148C 1923 nt13.66□□□□□ -0.22
SPC110P32380 SIS1YNL007C 1059 nt13.63□□□□□ -0.23
SPC110P32380 YGR021WYGR021W 873 nt13.6□□□□□ -0.23
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