RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 MAP7D2Q96T17 732 aa22.51■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 CRBNQ96SW2 442 aa22.5■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 PLIN1O60240 522 aa22.49■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.48■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.48■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.48■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.44■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 USP19O94966 1318 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 TMC1Q8TDI8 760 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 BECN1Q14457 450 aa22.42■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 SHROOM2Q13796 1616 aa22.42■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 TERF1P54274 439 aa22.4■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.4■■□□□ 1.18
GLIS1-201ENST00000312233 OFD1O75665 1012 aa22.39■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 MCM4P33991 863 aa22.39■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.39■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 HFM1A2PYH4 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.38■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 DMTNQ08495 405 aa22.37■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.37■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 PDE3BQ13370 1112 aa22.37■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.35■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 TRAK2O60296 914 aa22.35■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.34■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
GLIS1-201ENST00000312233 HECW1Q76N89 1606 aa22.32■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.32■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.32■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.3■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.3■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 PTPRKQ15262 1439 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 ARID3AQ99856 593 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.28■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM51Q9NW97 253 aa22.28■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 NAIPQ13075 1403 aa22.27■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.27■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GLIS1-201ENST00000312233 ARID3CA6NKF2 412 aa22.26■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 SEC24BO95487 1268 aa22.26■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.26■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 OSCARQ8IYS5 282 aa22.24■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 PTPRGP23470 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 ABCA8O94911 1581 aa22.22■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 NLRP1Q9C000 1473 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS1-201ENST00000312233 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.2■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 UQCRHP07919 91 aa22.2■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.2■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.2■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.19■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.18■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 KIF20AO95235 890 aa22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 FOXD1Q16676 465 aa22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 DYNC1I1O14576 645 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 MIA2Q96PC5 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.14■■□□□ 1.14
GLIS1-201ENST00000312233 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms