RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CHD1O14646 1710 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 STK26Q9P289 416 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2FA1L443 756 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 DISP1Q96F81 1524 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 UACAQ9BZF9 1416 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0556O60303 1618 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD9Q5K651 1589 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 ATF3P18847 181 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 SOX12O15370 315 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 TIAM1Q13009 1591 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 HECW1Q76N89 1606 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 TOM1O60784 492 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF11O15085 1522 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 TMC1Q8TDI8 760 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K1Q13233 1512 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ASXL2Q76L83 1435 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 NEFMP07197 916 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA2Q15596 1464 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ARXQ96QS3 562 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 ATP10BO94823 1461 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-201ENST00000348564 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 FOXD1Q16676 465 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 NUP155O75694 1391 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 EVA1CP58658 441 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 SHROOM2Q13796 1616 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA8O94911 1581 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 PKD2Q13563 968 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC2Q92887 1545 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL34Q8N239 644 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 AKNAQ7Z591 1439 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 NPHP1O15259 732 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 HRCP23327 699 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS2O95450 1211 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 PSME1Q06323 249 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 NGLY1Q96IV0 654 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 MSH5O43196 834 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 USP35Q9P2H5 1018 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-201ENST00000348564 MIA2Q96PC5 1412 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 KIF14Q15058 1648 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 TONSLQ96HA7 1378 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.13□□□□□ -1.43
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