RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Brpf1B2RRD7 1212 aa22.15■■□□□ 1.14
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.14■■□□□ 1.13
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.11■■□□□ 1.13
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 AppP12023 770 aa22.05■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CgnP59242 1191 aa22.05■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa22.05■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Golga2Q921M4 999 aa22.05■■□□□ 1.12
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyb5rlB1AS42 316 aa22.03■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rock2P70336 1388 aa22.03■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Srcin1Q9QWI6 1250 aa22.02■■□□□ 1.12
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Soga1E1U8D0 1418 aa21.94■■□□□ 1.1
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnn1Q9EQR3 537 aa21.9■■□□□ 1.1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa21.9■■□□□ 1.1
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zpr1Q62384 459 aa21.87■■□□□ 1.09
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