Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
Paf1Q8K2T8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Paf1Q8K2T8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Paf1Q8K2T8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Paf1Q8K2T8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Paf1Q8K2T8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Paf1Q8K2T8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Paf1Q8K2T8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Paf1Q8K2T8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Paf1Q8K2T8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Paf1Q8K2T8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Paf1Q8K2T8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Paf1Q8K2T8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Paf1Q8K2T8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Paf1Q8K2T8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Paf1Q8K2T8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Paf1Q8K2T8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Paf1Q8K2T8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Paf1Q8K2T8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Paf1Q8K2T8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Paf1Q8K2T8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Paf1Q8K2T8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Paf1Q8K2T8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Paf1Q8K2T8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Paf1Q8K2T8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Paf1Q8K2T8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Paf1Q8K2T8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Paf1Q8K2T8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Paf1Q8K2T8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Paf1Q8K2T8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Paf1Q8K2T8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Paf1Q8K2T8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Paf1Q8K2T8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Paf1Q8K2T8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Paf1Q8K2T8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Paf1Q8K2T8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Paf1Q8K2T8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Paf1Q8K2T8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Paf1Q8K2T8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Paf1Q8K2T8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Paf1Q8K2T8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Paf1Q8K2T8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Paf1Q8K2T8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Paf1Q8K2T8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Paf1Q8K2T8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Paf1Q8K2T8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Paf1Q8K2T8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Paf1Q8K2T8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Paf1Q8K2T8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Paf1Q8K2T8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Paf1Q8K2T8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Paf1Q8K2T8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Paf1Q8K2T8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Paf1Q8K2T8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Paf1Q8K2T8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Paf1Q8K2T8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Paf1Q8K2T8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Paf1Q8K2T8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Paf1Q8K2T8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Paf1Q8K2T8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Paf1Q8K2T8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Paf1Q8K2T8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Paf1Q8K2T8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Paf1Q8K2T8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Paf1Q8K2T8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Paf1Q8K2T8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Paf1Q8K2T8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Paf1Q8K2T8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Paf1Q8K2T8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Paf1Q8K2T8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Paf1Q8K2T8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Paf1Q8K2T8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Paf1Q8K2T8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Paf1Q8K2T8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Paf1Q8K2T8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Paf1Q8K2T8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Paf1Q8K2T8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Paf1Q8K2T8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Paf1Q8K2T8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Paf1Q8K2T8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Paf1Q8K2T8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Paf1Q8K2T8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Paf1Q8K2T8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Paf1Q8K2T8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Paf1Q8K2T8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Paf1Q8K2T8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Paf1Q8K2T8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Paf1Q8K2T8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Paf1Q8K2T8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Paf1Q8K2T8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Paf1Q8K2T8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Paf1Q8K2T8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Paf1Q8K2T8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Paf1Q8K2T8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Paf1Q8K2T8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Paf1Q8K2T8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Paf1Q8K2T8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Paf1Q8K2T8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Paf1Q8K2T8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Paf1Q8K2T8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms