Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CgnP59242 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CgnP59242 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CgnP59242 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CgnP59242 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CgnP59242 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CgnP59242 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CgnP59242 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CgnP59242 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CgnP59242 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CgnP59242 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CgnP59242 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CgnP59242 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CgnP59242 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CgnP59242 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CgnP59242 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CgnP59242 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CgnP59242 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CgnP59242 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CgnP59242 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CgnP59242 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CgnP59242 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CgnP59242 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CgnP59242 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CgnP59242 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CgnP59242 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CgnP59242 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CgnP59242 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CgnP59242 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CgnP59242 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CgnP59242 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CgnP59242 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CgnP59242 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CgnP59242 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CgnP59242 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CgnP59242 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CgnP59242 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CgnP59242 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CgnP59242 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CgnP59242 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CgnP59242 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CgnP59242 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CgnP59242 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CgnP59242 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CgnP59242 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CgnP59242 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CgnP59242 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CgnP59242 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CgnP59242 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CgnP59242 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CgnP59242 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CgnP59242 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CgnP59242 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CgnP59242 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CgnP59242 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CgnP59242 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CgnP59242 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CgnP59242 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CgnP59242 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CgnP59242 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CgnP59242 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CgnP59242 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CgnP59242 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CgnP59242 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CgnP59242 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CgnP59242 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CgnP59242 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CgnP59242 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CgnP59242 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CgnP59242 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CgnP59242 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CgnP59242 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CgnP59242 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CgnP59242 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CgnP59242 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CgnP59242 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CgnP59242 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CgnP59242 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CgnP59242 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CgnP59242 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CgnP59242 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CgnP59242 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CgnP59242 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CgnP59242 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CgnP59242 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CgnP59242 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CgnP59242 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CgnP59242 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CgnP59242 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CgnP59242 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CgnP59242 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CgnP59242 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CgnP59242 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CgnP59242 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CgnP59242 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CgnP59242 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CgnP59242 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CgnP59242 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CgnP59242 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CgnP59242 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 769.9 ms