Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Prm3Q62100 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Prm3Q62100 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prm3Q62100 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prm3Q62100 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prm3Q62100 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prm3Q62100 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prm3Q62100 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prm3Q62100 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prm3Q62100 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prm3Q62100 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Prm3Q62100 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prm3Q62100 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prm3Q62100 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prm3Q62100 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prm3Q62100 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prm3Q62100 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prm3Q62100 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prm3Q62100 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prm3Q62100 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prm3Q62100 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prm3Q62100 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prm3Q62100 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prm3Q62100 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prm3Q62100 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prm3Q62100 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prm3Q62100 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prm3Q62100 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prm3Q62100 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prm3Q62100 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prm3Q62100 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prm3Q62100 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prm3Q62100 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prm3Q62100 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prm3Q62100 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prm3Q62100 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prm3Q62100 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prm3Q62100 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Prm3Q62100 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prm3Q62100 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prm3Q62100 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prm3Q62100 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prm3Q62100 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prm3Q62100 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prm3Q62100 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prm3Q62100 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prm3Q62100 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prm3Q62100 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prm3Q62100 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prm3Q62100 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prm3Q62100 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prm3Q62100 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prm3Q62100 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prm3Q62100 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prm3Q62100 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prm3Q62100 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prm3Q62100 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prm3Q62100 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prm3Q62100 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prm3Q62100 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prm3Q62100 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prm3Q62100 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prm3Q62100 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prm3Q62100 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prm3Q62100 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prm3Q62100 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prm3Q62100 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prm3Q62100 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prm3Q62100 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prm3Q62100 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prm3Q62100 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Prm3Q62100 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prm3Q62100 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prm3Q62100 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prm3Q62100 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prm3Q62100 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prm3Q62100 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prm3Q62100 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prm3Q62100 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prm3Q62100 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prm3Q62100 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms