Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.31■■■■■ 6.44
Atf3Q60765 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Atf3Q60765 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Atf3Q60765 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
Atf3Q60765 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
Atf3Q60765 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Atf3Q60765 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Atf3Q60765 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Atf3Q60765 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
Atf3Q60765 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Atf3Q60765 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Atf3Q60765 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Atf3Q60765 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Atf3Q60765 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Atf3Q60765 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Atf3Q60765 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Atf3Q60765 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Atf3Q60765 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Atf3Q60765 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Atf3Q60765 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
Atf3Q60765 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Atf3Q60765 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Atf3Q60765 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Atf3Q60765 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Atf3Q60765 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Atf3Q60765 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Atf3Q60765 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Atf3Q60765 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Atf3Q60765 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Atf3Q60765 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Atf3Q60765 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Atf3Q60765 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Atf3Q60765 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Atf3Q60765 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Atf3Q60765 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Atf3Q60765 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Atf3Q60765 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Atf3Q60765 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Atf3Q60765 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Atf3Q60765 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Atf3Q60765 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Atf3Q60765 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Atf3Q60765 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Atf3Q60765 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Atf3Q60765 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Atf3Q60765 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Atf3Q60765 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Atf3Q60765 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Atf3Q60765 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Atf3Q60765 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Atf3Q60765 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Atf3Q60765 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Atf3Q60765 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Atf3Q60765 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Atf3Q60765 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Atf3Q60765 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Atf3Q60765 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Atf3Q60765 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Atf3Q60765 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Atf3Q60765 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Atf3Q60765 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Atf3Q60765 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Atf3Q60765 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Atf3Q60765 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Atf3Q60765 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Atf3Q60765 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Atf3Q60765 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Atf3Q60765 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Atf3Q60765 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Atf3Q60765 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Atf3Q60765 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Atf3Q60765 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Atf3Q60765 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Atf3Q60765 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Atf3Q60765 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Atf3Q60765 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Atf3Q60765 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
Atf3Q60765 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Atf3Q60765 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Atf3Q60765 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Atf3Q60765 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Atf3Q60765 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Atf3Q60765 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Atf3Q60765 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Atf3Q60765 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Atf3Q60765 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Atf3Q60765 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Atf3Q60765 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Atf3Q60765 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Atf3Q60765 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Atf3Q60765 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Atf3Q60765 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Atf3Q60765 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Atf3Q60765 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Atf3Q60765 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms