Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.42■■■■■ 7.9
Shroom4Q1W617 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
Shroom4Q1W617 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.65■■■■■ 6.98
Shroom4Q1W617 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.16■■■■■ 6.58
Shroom4Q1W617 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC56.02■■■■■ 6.56
Shroom4Q1W617 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC54.91■■■■■ 6.38
Shroom4Q1W617 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
Shroom4Q1W617 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.27■■■■■ 6.28
Shroom4Q1W617 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
Shroom4Q1W617 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.68■■■■■ 6.18
Shroom4Q1W617 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
Shroom4Q1W617 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
Shroom4Q1W617 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
Shroom4Q1W617 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.29■■■■■ 5.96
Shroom4Q1W617 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
Shroom4Q1W617 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.91
Shroom4Q1W617 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.71■■■■■ 5.87
Shroom4Q1W617 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
Shroom4Q1W617 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.57■■■■■ 5.85
Shroom4Q1W617 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
Shroom4Q1W617 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
Shroom4Q1W617 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
Shroom4Q1W617 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
Shroom4Q1W617 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
Shroom4Q1W617 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.96■■■■■ 5.75
Shroom4Q1W617 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC50.93■■■■■ 5.74
Shroom4Q1W617 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.85■■■■■ 5.73
Shroom4Q1W617 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
Shroom4Q1W617 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
Shroom4Q1W617 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Shroom4Q1W617 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
Shroom4Q1W617 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
Shroom4Q1W617 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC50.13■■■■■ 5.62
Shroom4Q1W617 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
Shroom4Q1W617 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
Shroom4Q1W617 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
Shroom4Q1W617 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.48■■■■■ 5.51
Shroom4Q1W617 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.42■■■■■ 5.5
Shroom4Q1W617 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
Shroom4Q1W617 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.3■■■■■ 5.48
Shroom4Q1W617 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
Shroom4Q1W617 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Shroom4Q1W617 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
Shroom4Q1W617 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC48.91■■■■■ 5.42
Shroom4Q1W617 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
Shroom4Q1W617 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
Shroom4Q1W617 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
Shroom4Q1W617 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Shroom4Q1W617 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Shroom4Q1W617 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Shroom4Q1W617 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
Shroom4Q1W617 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Shroom4Q1W617 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Shroom4Q1W617 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Shroom4Q1W617 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Shroom4Q1W617 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
Shroom4Q1W617 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
Shroom4Q1W617 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Shroom4Q1W617 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Shroom4Q1W617 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Shroom4Q1W617 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Shroom4Q1W617 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Shroom4Q1W617 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
Shroom4Q1W617 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Shroom4Q1W617 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.63■■■■■ 5.22
Shroom4Q1W617 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
Shroom4Q1W617 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Shroom4Q1W617 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Shroom4Q1W617 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Shroom4Q1W617 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
Shroom4Q1W617 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Shroom4Q1W617 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Shroom4Q1W617 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
Shroom4Q1W617 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Shroom4Q1W617 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Shroom4Q1W617 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Shroom4Q1W617 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Shroom4Q1W617 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Shroom4Q1W617 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Shroom4Q1W617 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Shroom4Q1W617 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Shroom4Q1W617 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Shroom4Q1W617 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
Shroom4Q1W617 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Shroom4Q1W617 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
Shroom4Q1W617 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
Shroom4Q1W617 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Shroom4Q1W617 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Shroom4Q1W617 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Shroom4Q1W617 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Shroom4Q1W617 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Shroom4Q1W617 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Shroom4Q1W617 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Shroom4Q1W617 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Shroom4Q1W617 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Shroom4Q1W617 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
Shroom4Q1W617 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Shroom4Q1W617 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Shroom4Q1W617 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
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