Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Pcmtd1P59913 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Pcmtd1P59913 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pcmtd1P59913 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pcmtd1P59913 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Pcmtd1P59913 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pcmtd1P59913 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcmtd1P59913 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcmtd1P59913 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pcmtd1P59913 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pcmtd1P59913 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcmtd1P59913 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcmtd1P59913 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pcmtd1P59913 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pcmtd1P59913 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Pcmtd1P59913 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcmtd1P59913 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcmtd1P59913 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcmtd1P59913 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcmtd1P59913 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcmtd1P59913 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Pcmtd1P59913 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcmtd1P59913 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pcmtd1P59913 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcmtd1P59913 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pcmtd1P59913 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Pcmtd1P59913 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcmtd1P59913 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcmtd1P59913 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcmtd1P59913 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcmtd1P59913 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcmtd1P59913 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcmtd1P59913 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Pcmtd1P59913 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pcmtd1P59913 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcmtd1P59913 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pcmtd1P59913 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pcmtd1P59913 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcmtd1P59913 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcmtd1P59913 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcmtd1P59913 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pcmtd1P59913 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pcmtd1P59913 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcmtd1P59913 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pcmtd1P59913 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pcmtd1P59913 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pcmtd1P59913 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcmtd1P59913 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pcmtd1P59913 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcmtd1P59913 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Pcmtd1P59913 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcmtd1P59913 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcmtd1P59913 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcmtd1P59913 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcmtd1P59913 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcmtd1P59913 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcmtd1P59913 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcmtd1P59913 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcmtd1P59913 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcmtd1P59913 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcmtd1P59913 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcmtd1P59913 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcmtd1P59913 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcmtd1P59913 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pcmtd1P59913 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pcmtd1P59913 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pcmtd1P59913 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcmtd1P59913 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcmtd1P59913 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcmtd1P59913 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcmtd1P59913 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcmtd1P59913 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pcmtd1P59913 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcmtd1P59913 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcmtd1P59913 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pcmtd1P59913 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pcmtd1P59913 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pcmtd1P59913 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcmtd1P59913 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Pcmtd1P59913 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pcmtd1P59913 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Pcmtd1P59913 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Pcmtd1P59913 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Pcmtd1P59913 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Pcmtd1P59913 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pcmtd1P59913 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcmtd1P59913 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcmtd1P59913 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcmtd1P59913 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcmtd1P59913 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcmtd1P59913 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcmtd1P59913 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcmtd1P59913 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcmtd1P59913 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pcmtd1P59913 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms