Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.89■■■■■ 6.22
Sirt1Q923E4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Sirt1Q923E4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Sirt1Q923E4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.88■■■■■ 5.1
Sirt1Q923E4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Sirt1Q923E4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
Sirt1Q923E4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Sirt1Q923E4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Sirt1Q923E4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Sirt1Q923E4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
Sirt1Q923E4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Sirt1Q923E4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Sirt1Q923E4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Sirt1Q923E4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Sirt1Q923E4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Sirt1Q923E4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Sirt1Q923E4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sirt1Q923E4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Sirt1Q923E4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Sirt1Q923E4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Sirt1Q923E4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Sirt1Q923E4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Sirt1Q923E4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Sirt1Q923E4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Sirt1Q923E4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Sirt1Q923E4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Sirt1Q923E4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Sirt1Q923E4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Sirt1Q923E4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Sirt1Q923E4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Sirt1Q923E4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Sirt1Q923E4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sirt1Q923E4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
Sirt1Q923E4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Sirt1Q923E4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Sirt1Q923E4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Sirt1Q923E4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Sirt1Q923E4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sirt1Q923E4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Sirt1Q923E4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Sirt1Q923E4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Sirt1Q923E4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Sirt1Q923E4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Sirt1Q923E4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Sirt1Q923E4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Sirt1Q923E4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Sirt1Q923E4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sirt1Q923E4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Sirt1Q923E4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Sirt1Q923E4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sirt1Q923E4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Sirt1Q923E4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Sirt1Q923E4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Sirt1Q923E4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Sirt1Q923E4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Sirt1Q923E4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Sirt1Q923E4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sirt1Q923E4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sirt1Q923E4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Sirt1Q923E4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Sirt1Q923E4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Sirt1Q923E4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sirt1Q923E4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Sirt1Q923E4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Sirt1Q923E4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Sirt1Q923E4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Sirt1Q923E4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Sirt1Q923E4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Sirt1Q923E4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Sirt1Q923E4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Sirt1Q923E4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Sirt1Q923E4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Sirt1Q923E4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Sirt1Q923E4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Sirt1Q923E4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Sirt1Q923E4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Sirt1Q923E4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sirt1Q923E4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sirt1Q923E4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Sirt1Q923E4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sirt1Q923E4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Sirt1Q923E4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Sirt1Q923E4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sirt1Q923E4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Sirt1Q923E4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Sirt1Q923E4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sirt1Q923E4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Sirt1Q923E4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sirt1Q923E4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sirt1Q923E4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Sirt1Q923E4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Sirt1Q923E4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Sirt1Q923E4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Sirt1Q923E4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Sirt1Q923E4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sirt1Q923E4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Sirt1Q923E4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms