Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.8■■■■■ 6.36
Fan1Q69ZT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
Fan1Q69ZT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
Fan1Q69ZT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
Fan1Q69ZT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
Fan1Q69ZT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
Fan1Q69ZT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Fan1Q69ZT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Fan1Q69ZT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Fan1Q69ZT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Fan1Q69ZT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Fan1Q69ZT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Fan1Q69ZT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Fan1Q69ZT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Fan1Q69ZT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Fan1Q69ZT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
Fan1Q69ZT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Fan1Q69ZT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Fan1Q69ZT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Fan1Q69ZT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Fan1Q69ZT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Fan1Q69ZT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fan1Q69ZT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Fan1Q69ZT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Fan1Q69ZT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Fan1Q69ZT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Fan1Q69ZT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Fan1Q69ZT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Fan1Q69ZT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Fan1Q69ZT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
Fan1Q69ZT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Fan1Q69ZT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Fan1Q69ZT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Fan1Q69ZT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Fan1Q69ZT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Fan1Q69ZT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Fan1Q69ZT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Fan1Q69ZT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Fan1Q69ZT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Fan1Q69ZT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Fan1Q69ZT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fan1Q69ZT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fan1Q69ZT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Fan1Q69ZT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Fan1Q69ZT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Fan1Q69ZT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Fan1Q69ZT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Fan1Q69ZT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Fan1Q69ZT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Fan1Q69ZT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Fan1Q69ZT1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Fan1Q69ZT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Fan1Q69ZT1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Fan1Q69ZT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Fan1Q69ZT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Fan1Q69ZT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Fan1Q69ZT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Fan1Q69ZT1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Fan1Q69ZT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Fan1Q69ZT1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fan1Q69ZT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fan1Q69ZT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Fan1Q69ZT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Fan1Q69ZT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Fan1Q69ZT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Fan1Q69ZT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Fan1Q69ZT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Fan1Q69ZT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Fan1Q69ZT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Fan1Q69ZT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Fan1Q69ZT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Fan1Q69ZT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fan1Q69ZT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Fan1Q69ZT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Fan1Q69ZT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Fan1Q69ZT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Fan1Q69ZT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Fan1Q69ZT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Fan1Q69ZT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Fan1Q69ZT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Fan1Q69ZT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Fan1Q69ZT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Fan1Q69ZT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Fan1Q69ZT1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Fan1Q69ZT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Fan1Q69ZT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Fan1Q69ZT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Fan1Q69ZT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Fan1Q69ZT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Fan1Q69ZT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Fan1Q69ZT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
Fan1Q69ZT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Fan1Q69ZT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Fan1Q69ZT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms