RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb12Q8K4N3 78 aa10.85□□□□□ -0.67
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa10.84□□□□□ -0.67
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10337F7DEP7 55 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap14O08640 167 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10197F6QEY5 67 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bean1Q9EQG5 255 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chtf8P0CG14 533 aa10.77□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa10.76□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa10.75□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anapc11Q9CPX9 84 aa10.75□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al1bA0A087WP11 105 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al1kJ3QP08 105 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al1eQ810S6 105 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al1mQ9DAD9 105 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10267M0QWD8 85 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl55Q9CZ83 127 aa10.74□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap10-4Q08EG8 221 aa10.71□□□□□ -0.69
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10160F6Y577 67 aa10.69□□□□□ -0.7
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phxr4P15974 95 aa10.65□□□□□ -0.7
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah5Q8VHE6 4621 aa10.64□□□□□ -0.71
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah2P0C6F1 4456 aa10.64□□□□□ -0.71
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps13dB1ART2 4390 aa10.62□□□□□ -0.71
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10643Q3URG9 111 aa10.58□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hectd4E9Q2E4 4418 aa10.58□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cypt15B1AXS0 87 aa10.58□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OxtP35454 125 aa10.57□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sox16Q62247 57 aa10.55□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ApobE9Q414 4505 aa10.55□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap13O88375 197 aa10.52□□□□□ -0.72
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb13Q8R2I4 64 aa10.51□□□□□ -0.73
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spaca4Q80ZQ0 127 aa10.5□□□□□ -0.73
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pkd1O08852 4293 aa10.49□□□□□ -0.73
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb38Q7TNV7 63 aa10.43□□□□□ -0.74
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4933415A04RikQ9D443 101 aa10.42□□□□□ -0.74
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20661K7N787 53 aa10.41□□□□□ -0.74
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm2696A0A1W2P709 240 aa10.4□□□□□ -0.74
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21798J3QNU5 87 aa10.39□□□□□ -0.75
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stard9Q80TF6 4561 aa10.36□□□□□ -0.75
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrp1bQ9JI18 4599 aa10.34□□□□□ -0.75
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndufb1P0DN34 57 aa10.34□□□□□ -0.75
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps29P62274 56 aa10.28□□□□□ -0.76
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Limd2Q8BGB5 128 aa10.27□□□□□ -0.77
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uqcr11Q9CPX8 56 aa10.25□□□□□ -0.77
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc3Q14AE4 130 aa10.23□□□□□ -0.77
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pkhd1E9PZ36 4059 aa10.21□□□□□ -0.77
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa10.2□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10999F6Q4M4 69 aa10.19□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SptssbQ925E8 76 aa10.18□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap3-2Q9D638 99 aa10.18□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa10.18□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SacsQ9JLC8 4582 aa10.17□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fat2Q5F226 4351 aa10.16□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm26620Q9CY65 116 aa10.15□□□□□ -0.78
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A930033H14RikG5E8X6 103 aa10.15□□□□□ -0.79
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2310034C09RikQ9D746 214 aa10.15□□□□□ -0.79
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8BGJ3 129 aa10.14□□□□□ -0.79
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa10.13□□□□□ -0.79
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RetnlbQ99P86 105 aa10.09□□□□□ -0.79
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa10.05□□□□□ -0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11939A2A592 99 aa10□□□□□ -0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ryr3A2AGL3 4863 aa10□□□□□ -0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm4491E0CX42 125 aa9.95□□□□□ -0.82
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3646F6S692 53 aa9.95□□□□□ -0.82
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa9.94□□□□□ -0.82
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa9.91□□□□□ -0.82
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ryr1E9PZQ0 5035 aa9.85□□□□□ -0.83
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb1P56386 69 aa9.85□□□□□ -0.83
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps13bQ80TY5 3993 aa9.78□□□□□ -0.84
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa9.78□□□□□ -0.84
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 9230102O04RikA2ASX7 82 aa9.74□□□□□ -0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700042G07RikB1AUF7 90 aa9.73□□□□□ -0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap19-5O08632 62 aa9.72□□□□□ -0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa9.69□□□□□ -0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndufs5Q99LY9 106 aa9.66□□□□□ -0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cox6b2Q80ZN9 88 aa9.65□□□□□ -0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sec61gP60060 68 aa9.63□□□□□ -0.87
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fat3Q8BNA6 4555 aa9.59□□□□□ -0.87
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah8Q91XQ0 4731 aa9.54□□□□□ -0.88
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa9.52□□□□□ -0.88
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl37Q9D823 97 aa9.51□□□□□ -0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pla2g10Q9QXX3 151 aa9.51□□□□□ -0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnase13Q5GAM7 153 aa9.48□□□□□ -0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5965D3Z724 196 aa9.41□□□□□ -0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17416Q30KP4 66 aa9.39□□□□□ -0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa9.39□□□□□ -0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20537G3UYK7 97 aa9.36□□□□□ -0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca13Q5SSE9 5034 aa9.36□□□□□ -0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa9.31□□□□□ -0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9955Q8CEJ8 102 aa9.31□□□□□ -0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17606F6ZL36 78 aa9.31□□□□□ -0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9821Q8K076 103 aa9.27□□□□□ -0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Herc2Q4U2R1 4836 aa9.23□□□□□ -0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10382Q3V0T5 144 aa9.22□□□□□ -0.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa9.2□□□□□ -0.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Birc6O88738 4882 aa9.2□□□□□ -0.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap3-1A2A591 98 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.1 ms