Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
1700042G07RikB1AUF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700042G07RikB1AUF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700042G07RikB1AUF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700042G07RikB1AUF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700042G07RikB1AUF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700042G07RikB1AUF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700042G07RikB1AUF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700042G07RikB1AUF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700042G07RikB1AUF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700042G07RikB1AUF7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700042G07RikB1AUF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700042G07RikB1AUF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700042G07RikB1AUF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700042G07RikB1AUF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700042G07RikB1AUF7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700042G07RikB1AUF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700042G07RikB1AUF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700042G07RikB1AUF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700042G07RikB1AUF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700042G07RikB1AUF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700042G07RikB1AUF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700042G07RikB1AUF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700042G07RikB1AUF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700042G07RikB1AUF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700042G07RikB1AUF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700042G07RikB1AUF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700042G07RikB1AUF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700042G07RikB1AUF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700042G07RikB1AUF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700042G07RikB1AUF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700042G07RikB1AUF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700042G07RikB1AUF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700042G07RikB1AUF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700042G07RikB1AUF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700042G07RikB1AUF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700042G07RikB1AUF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700042G07RikB1AUF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700042G07RikB1AUF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700042G07RikB1AUF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700042G07RikB1AUF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700042G07RikB1AUF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700042G07RikB1AUF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700042G07RikB1AUF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700042G07RikB1AUF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700042G07RikB1AUF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700042G07RikB1AUF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700042G07RikB1AUF7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700042G07RikB1AUF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700042G07RikB1AUF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700042G07RikB1AUF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700042G07RikB1AUF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700042G07RikB1AUF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700042G07RikB1AUF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700042G07RikB1AUF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700042G07RikB1AUF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700042G07RikB1AUF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700042G07RikB1AUF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700042G07RikB1AUF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700042G07RikB1AUF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700042G07RikB1AUF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700042G07RikB1AUF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700042G07RikB1AUF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700042G07RikB1AUF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700042G07RikB1AUF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700042G07RikB1AUF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700042G07RikB1AUF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700042G07RikB1AUF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700042G07RikB1AUF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700042G07RikB1AUF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700042G07RikB1AUF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700042G07RikB1AUF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
1700042G07RikB1AUF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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