Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY9

Ndufs5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs5Q99LY9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufs5Q99LY9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufs5Q99LY9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs5Q99LY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs5Q99LY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs5Q99LY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufs5Q99LY9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufs5Q99LY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufs5Q99LY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufs5Q99LY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs5Q99LY9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs5Q99LY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufs5Q99LY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs5Q99LY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs5Q99LY9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs5Q99LY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs5Q99LY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs5Q99LY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs5Q99LY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs5Q99LY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufs5Q99LY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs5Q99LY9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs5Q99LY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs5Q99LY9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufs5Q99LY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs5Q99LY9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs5Q99LY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs5Q99LY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufs5Q99LY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufs5Q99LY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs5Q99LY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs5Q99LY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs5Q99LY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs5Q99LY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs5Q99LY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs5Q99LY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs5Q99LY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs5Q99LY9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs5Q99LY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs5Q99LY9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs5Q99LY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs5Q99LY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs5Q99LY9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs5Q99LY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs5Q99LY9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs5Q99LY9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs5Q99LY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs5Q99LY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufs5Q99LY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs5Q99LY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs5Q99LY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms