RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NischQ80TM9 1593 aa35.76■■■■□ 3.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa35.47■■■■□ 3.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcc9P70170 1546 aa34.84■■■■□ 3.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.05■■■■□ 3.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rtl1Q7M732 1744 aa32.74■■■□□ 2.83
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.6■■■□□ 2.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.99■■■□□ 2.71
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.97■■■□□ 2.71
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ScribQ80U72 1612 aa31.73■■■□□ 2.67
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.32■■■□□ 2.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kdm5dQ62240 1548 aa31.13■■■□□ 2.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Baz1aO88379 1555 aa31.04■■■□□ 2.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NacadQ5SWP3 1504 aa30.97■■■□□ 2.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.67■■■□□ 2.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HrcG5E8J6 738 aa30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30.29■■■□□ 2.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.18■■■□□ 2.42
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim41Q5NCC3 630 aa29.89■■■□□ 2.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.87■■■□□ 2.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BicraF8VPZ9 1578 aa29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep164Q5DU05 1446 aa29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.25■■■□□ 2.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Golga3P55937 1487 aa29.2■■■□□ 2.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CftrP26361 1476 aa29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Top2bQ64511 1612 aa28.96■■■□□ 2.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.94■■■□□ 2.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chic1Q8CBW7 227 aa28.84■■■□□ 2.21
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.51■■■□□ 2.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fmn1Q05860 1466 aa28.5■■■□□ 2.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gab3Q8BSM5 595 aa28.42■■■□□ 2.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TnnQ80Z71 1560 aa28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep162Q6ZQ06 1403 aa27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Frmpd1A2AKB4 1549 aa27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NefmP08553 848 aa27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcgf6Q99NA9 353 aa27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ercc6F8VPZ5 1481 aa27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mier1Q5UAK0 511 aa27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Unc13aQ4KUS2 1712 aa27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NrkQ9R0G8 1455 aa27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Npm2Q80W85 207 aa27.57■■■□□ 2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.56■■■□□ 2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.54■■■□□ 2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.53■■■□□ 2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Shroom4Q1W617 1475 aa27.5■■□□□ 1.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map3k1P53349 1493 aa27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myt1lP97500 1187 aa27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clip1Q922J3 1391 aa27.45■■□□□ 1.98
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtprkP35822 1457 aa27.45■■□□□ 1.98
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grin2bQ01097 1482 aa27.36■■□□□ 1.97
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eea1Q8BL66 1411 aa27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il27Q8K3I6 234 aa27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arap1Q4LDD4 1452 aa27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zeb1Q64318 1117 aa27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Erich3F6QRE9 1637 aa27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cux2P70298 1426 aa27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Setd5Q5XJV7 1441 aa27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Efcab5A0JP43 1406 aa27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tiam1Q60610 1591 aa27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubl4bQ9CQ84 188 aa27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Carmil1Q6EDY6 1374 aa26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Naip1Q9QWK5 1403 aa26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Duox2A2AQ99 1517 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms