RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 9430015G10RikA2ASP7 199 aa11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17577J3QNF7 156 aa11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox7b2Q9D2H1 82 aa11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd164Q9R0L9 197 aa11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 E130114P18RikF6S0S7 154 aa11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa11.3□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elof1P60003 83 aa11.3□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa23Q5G866 93 aa11.29□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itpr2Q9Z329 2701 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7138L7N2C3 230 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Reg3bP35230 175 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem258P61166 79 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smim29Q8R043 75 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3238W4VSP7 230 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phxr5P08399 672 aa11.27□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Notch2O35516 2470 aa11.27□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa11.27□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr4Q8CGN8 76 aa11.26□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AtrQ9JKK8 2635 aa11.26□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa11.26□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam19a3Q7TPG6 132 aa11.26□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camk2n2Q78WH7 79 aa11.24□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GhrhP16043 103 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps28P62858 69 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa11.22□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC048502Q80Y74 154 aa11.22□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pde6gP09174 87 aa11.21□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa11.21□□□□□ -0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vpreb2P13373 142 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah3Q8BW94 4083 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01821 116 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pou2af1Q64693 256 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa11.2□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7276Q3TYW4 209 aa11.19□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AplnQ9R0R4 77 aa11.19□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A330070K13RikQ8CA53 115 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5617Q91VN2 117 aa11.16□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BikO70337 150 aa11.15□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufc1Q9CQY9 76 aa11.15□□□□□ -0.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprqP0C5E4 2300 aa11.14□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Notch1Q01705 2531 aa11.13□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Samd13D3YUG0 102 aa11.11□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa11.11□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A0A286YE02 88 aa11.1□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stab1Q8R4Y4 2571 aa11.1□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SnurfQ9WU12 71 aa11.08□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam168bQ80XQ8 194 aa11.07□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P84750 121 aa11.07□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr2jO70561 109 aa11.06□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm16485Q8C4B7 115 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm16181B0V2H2 73 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col6a5A6H584 2640 aa11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr1aQ62266 144 aa11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brk1Q91VR8 75 aa11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox6a2P43023 97 aa11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam19a5Q91WE9 132 aa11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11011D3Z3L9 86 aa11.03□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hivep1Q03172 2688 aa11.03□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7137J3QMW1 236 aa11.02□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dmac1Q9CQ00 111 aa11.02□□□□□ -0.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P06320 134 aa11.02□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sfta2E9PXB6 77 aa11.01□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa11.01□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C130032M10RikQ8C888 123 aa11□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11627A6PWP4 55 aa10.99□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr15lQ8JZM2 100 aa10.99□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BT88 171 aa10.99□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfdc6bF6ULY1 148 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah1E9Q8T7 4250 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vpreb1P13372 142 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PscaP57096 123 aa10.97□□□□□ -0.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah10D3YYQ8 4591 aa10.96□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2al1aQ5M8Q2 105 aa10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VwfQ8CIZ8 2813 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl34Q99N91 92 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serp1Q9Z1W5 66 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa27F2Z403 93 aa10.93□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa10.93□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa10.93□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah17Q69Z23 4481 aa10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vpreb3D3Z6J4 130 aa10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Obox2E9PXV9 151 aa10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prol1E9PYQ4 312 aa10.92□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10401E9Q3K6 71 aa10.91□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defb40Q70KL2 73 aa10.91□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnah6E9Q0B6 4144 aa10.9□□□□□ -0.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.8 ms