Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
6430550D23RikE9Q1X6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
6430550D23RikE9Q1X6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
6430550D23RikE9Q1X6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
6430550D23RikE9Q1X6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
6430550D23RikE9Q1X6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
6430550D23RikE9Q1X6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
6430550D23RikE9Q1X6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
6430550D23RikE9Q1X6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6430550D23RikE9Q1X6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
6430550D23RikE9Q1X6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
6430550D23RikE9Q1X6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
6430550D23RikE9Q1X6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430550D23RikE9Q1X6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6430550D23RikE9Q1X6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6430550D23RikE9Q1X6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
6430550D23RikE9Q1X6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
6430550D23RikE9Q1X6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6430550D23RikE9Q1X6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
6430550D23RikE9Q1X6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6430550D23RikE9Q1X6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
6430550D23RikE9Q1X6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
6430550D23RikE9Q1X6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430550D23RikE9Q1X6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
6430550D23RikE9Q1X6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430550D23RikE9Q1X6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430550D23RikE9Q1X6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
6430550D23RikE9Q1X6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
6430550D23RikE9Q1X6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
6430550D23RikE9Q1X6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6430550D23RikE9Q1X6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
6430550D23RikE9Q1X6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
6430550D23RikE9Q1X6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
6430550D23RikE9Q1X6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430550D23RikE9Q1X6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430550D23RikE9Q1X6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6430550D23RikE9Q1X6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6430550D23RikE9Q1X6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
6430550D23RikE9Q1X6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6430550D23RikE9Q1X6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6430550D23RikE9Q1X6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
6430550D23RikE9Q1X6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
6430550D23RikE9Q1X6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
6430550D23RikE9Q1X6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430550D23RikE9Q1X6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
6430550D23RikE9Q1X6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
6430550D23RikE9Q1X6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6430550D23RikE9Q1X6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6430550D23RikE9Q1X6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6430550D23RikE9Q1X6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
6430550D23RikE9Q1X6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
6430550D23RikE9Q1X6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
6430550D23RikE9Q1X6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430550D23RikE9Q1X6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430550D23RikE9Q1X6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430550D23RikE9Q1X6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
6430550D23RikE9Q1X6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6430550D23RikE9Q1X6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430550D23RikE9Q1X6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430550D23RikE9Q1X6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430550D23RikE9Q1X6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430550D23RikE9Q1X6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430550D23RikE9Q1X6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
6430550D23RikE9Q1X6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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