Protein–RNA interactions for Protein: Q64693

Pou2af1, POU domain class 2-associating factor 1, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2af1Q64693 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou2af1Q64693 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou2af1Q64693 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou2af1Q64693 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou2af1Q64693 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou2af1Q64693 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2af1Q64693 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou2af1Q64693 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou2af1Q64693 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou2af1Q64693 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou2af1Q64693 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou2af1Q64693 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou2af1Q64693 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou2af1Q64693 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou2af1Q64693 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2af1Q64693 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou2af1Q64693 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2af1Q64693 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou2af1Q64693 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou2af1Q64693 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2af1Q64693 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2af1Q64693 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pou2af1Q64693 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2af1Q64693 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2af1Q64693 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou2af1Q64693 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou2af1Q64693 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou2af1Q64693 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou2af1Q64693 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou2af1Q64693 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou2af1Q64693 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou2af1Q64693 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou2af1Q64693 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou2af1Q64693 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou2af1Q64693 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou2af1Q64693 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2af1Q64693 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou2af1Q64693 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou2af1Q64693 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou2af1Q64693 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou2af1Q64693 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou2af1Q64693 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou2af1Q64693 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou2af1Q64693 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou2af1Q64693 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou2af1Q64693 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou2af1Q64693 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou2af1Q64693 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou2af1Q64693 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou2af1Q64693 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou2af1Q64693 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou2af1Q64693 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou2af1Q64693 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou2af1Q64693 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou2af1Q64693 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou2af1Q64693 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou2af1Q64693 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou2af1Q64693 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou2af1Q64693 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou2af1Q64693 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou2af1Q64693 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou2af1Q64693 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou2af1Q64693 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou2af1Q64693 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou2af1Q64693 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou2af1Q64693 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou2af1Q64693 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou2af1Q64693 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2af1Q64693 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2af1Q64693 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2af1Q64693 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2af1Q64693 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2af1Q64693 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2af1Q64693 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2af1Q64693 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2af1Q64693 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2af1Q64693 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2af1Q64693 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2af1Q64693 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou2af1Q64693 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou2af1Q64693 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou2af1Q64693 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou2af1Q64693 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2af1Q64693 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2af1Q64693 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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