Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17577J3QNF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17577J3QNF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17577J3QNF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17577J3QNF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17577J3QNF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17577J3QNF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm17577J3QNF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm17577J3QNF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm17577J3QNF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17577J3QNF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm17577J3QNF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17577J3QNF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm17577J3QNF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17577J3QNF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17577J3QNF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17577J3QNF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm17577J3QNF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm17577J3QNF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm17577J3QNF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm17577J3QNF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm17577J3QNF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm17577J3QNF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17577J3QNF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm17577J3QNF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17577J3QNF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17577J3QNF7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm17577J3QNF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm17577J3QNF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm17577J3QNF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm17577J3QNF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17577J3QNF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17577J3QNF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17577J3QNF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17577J3QNF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17577J3QNF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17577J3QNF7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17577J3QNF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm17577J3QNF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17577J3QNF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17577J3QNF7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17577J3QNF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm17577J3QNF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17577J3QNF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17577J3QNF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17577J3QNF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17577J3QNF7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17577J3QNF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17577J3QNF7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17577J3QNF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17577J3QNF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm17577J3QNF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm17577J3QNF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17577J3QNF7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17577J3QNF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17577J3QNF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17577J3QNF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17577J3QNF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17577J3QNF7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17577J3QNF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17577J3QNF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17577J3QNF7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm17577J3QNF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17577J3QNF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17577J3QNF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17577J3QNF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17577J3QNF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17577J3QNF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17577J3QNF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17577J3QNF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17577J3QNF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17577J3QNF7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17577J3QNF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17577J3QNF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17577J3QNF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17577J3QNF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17577J3QNF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17577J3QNF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17577J3QNF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17577J3QNF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17577J3QNF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17577J3QNF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17577J3QNF7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17577J3QNF7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17577J3QNF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17577J3QNF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17577J3QNF7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17577J3QNF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17577J3QNF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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