Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0R4

Apln, Apelin, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplnQ9R0R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AplnQ9R0R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AplnQ9R0R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AplnQ9R0R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AplnQ9R0R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AplnQ9R0R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AplnQ9R0R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AplnQ9R0R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AplnQ9R0R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AplnQ9R0R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AplnQ9R0R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AplnQ9R0R4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AplnQ9R0R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AplnQ9R0R4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AplnQ9R0R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AplnQ9R0R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AplnQ9R0R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AplnQ9R0R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AplnQ9R0R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplnQ9R0R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AplnQ9R0R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AplnQ9R0R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AplnQ9R0R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AplnQ9R0R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AplnQ9R0R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AplnQ9R0R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AplnQ9R0R4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AplnQ9R0R4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AplnQ9R0R4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AplnQ9R0R4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AplnQ9R0R4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AplnQ9R0R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AplnQ9R0R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AplnQ9R0R4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AplnQ9R0R4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AplnQ9R0R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AplnQ9R0R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AplnQ9R0R4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AplnQ9R0R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AplnQ9R0R4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AplnQ9R0R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AplnQ9R0R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AplnQ9R0R4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AplnQ9R0R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplnQ9R0R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplnQ9R0R4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplnQ9R0R4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AplnQ9R0R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AplnQ9R0R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AplnQ9R0R4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AplnQ9R0R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AplnQ9R0R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplnQ9R0R4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplnQ9R0R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplnQ9R0R4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplnQ9R0R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AplnQ9R0R4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplnQ9R0R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AplnQ9R0R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AplnQ9R0R4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AplnQ9R0R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AplnQ9R0R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
AplnQ9R0R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AplnQ9R0R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AplnQ9R0R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AplnQ9R0R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AplnQ9R0R4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AplnQ9R0R4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AplnQ9R0R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AplnQ9R0R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplnQ9R0R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplnQ9R0R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AplnQ9R0R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplnQ9R0R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplnQ9R0R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplnQ9R0R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplnQ9R0R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AplnQ9R0R4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AplnQ9R0R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AplnQ9R0R4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
AplnQ9R0R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AplnQ9R0R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AplnQ9R0R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AplnQ9R0R4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AplnQ9R0R4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AplnQ9R0R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AplnQ9R0R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplnQ9R0R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplnQ9R0R4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms