RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NischQ80TM9 1593 aa32.65■■■□□ 2.82
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.06■■■□□ 2.72
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcc9P70170 1546 aa31.76■■■□□ 2.67
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcc8B2RUS7 1588 aa30.95■■■□□ 2.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.37■■■□□ 2.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rtl1Q7M732 1744 aa30.37■■■□□ 2.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.84■■■□□ 2.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.85■■■□□ 2.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ScribQ80U72 1612 aa28.82■■■□□ 2.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.66■■■□□ 2.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Baz1aO88379 1555 aa28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm5dQ62240 1548 aa28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HrcG5E8J6 738 aa28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NacadQ5SWP3 1504 aa27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smarca2Q6DIC0 1577 aa27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim41Q5NCC3 630 aa27.66■■■□□ 2.02
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep164Q5DU05 1446 aa27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sycp2Q9CUU3 1500 aa27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcgf6Q99NA9 353 aa27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chic1Q8CBW7 227 aa26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Golga3P55937 1487 aa26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BicraF8VPZ9 1578 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gab3Q8BSM5 595 aa26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Top2bQ64511 1612 aa26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CftrP26361 1476 aa26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mier1Q5UAK0 511 aa26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NefmP08553 848 aa26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zeb1Q64318 1117 aa26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fmn1Q05860 1466 aa26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Neurod1Q60867 357 aa26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sall2Q9QX96 1004 aa25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.89■■□□□ 1.73
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myt1lP97500 1187 aa25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TnnQ80Z71 1560 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npm2Q80W85 207 aa25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clip1Q922J3 1391 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr66E9Q743 1299 aa25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa25.43■■□□□ 1.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.41■■□□□ 1.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClspnQ80YR7 1315 aa25.38■■□□□ 1.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anks4bQ8K3X6 423 aa25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprkP35822 1457 aa25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NrkQ9R0G8 1455 aa25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TonslQ6NZL6 1363 aa25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frmpd1A2AKB4 1549 aa25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc13aQ4KUS2 1712 aa25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm5bQ80Y84 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eea1Q8BL66 1411 aa25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shroom4Q1W617 1475 aa25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Csrnp3P59055 597 aa25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map3k1P53349 1493 aa25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Setd5Q5XJV7 1441 aa25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il27Q8K3I6 234 aa25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tiam1Q60610 1591 aa25.02■■□□□ 1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Erich3F6QRE9 1637 aa25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.97■■□□□ 1.59
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grin2bQ01097 1482 aa24.95■■□□□ 1.59
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.91■■□□□ 1.58
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