Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk2ap2Q9CPY4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk2ap2Q9CPY4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk2ap2Q9CPY4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk2ap2Q9CPY4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk2ap2Q9CPY4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk2ap2Q9CPY4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk2ap2Q9CPY4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk2ap2Q9CPY4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk2ap2Q9CPY4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk2ap2Q9CPY4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk2ap2Q9CPY4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk2ap2Q9CPY4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk2ap2Q9CPY4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk2ap2Q9CPY4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk2ap2Q9CPY4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk2ap2Q9CPY4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk2ap2Q9CPY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk2ap2Q9CPY4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdk2ap2Q9CPY4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk2ap2Q9CPY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk2ap2Q9CPY4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk2ap2Q9CPY4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk2ap2Q9CPY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk2ap2Q9CPY4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk2ap2Q9CPY4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk2ap2Q9CPY4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk2ap2Q9CPY4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk2ap2Q9CPY4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk2ap2Q9CPY4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk2ap2Q9CPY4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk2ap2Q9CPY4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk2ap2Q9CPY4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk2ap2Q9CPY4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk2ap2Q9CPY4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk2ap2Q9CPY4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk2ap2Q9CPY4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk2ap2Q9CPY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk2ap2Q9CPY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk2ap2Q9CPY4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk2ap2Q9CPY4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk2ap2Q9CPY4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk2ap2Q9CPY4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms