RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640577.1

SPIN3-242, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-242ENST00000640577 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SPIN3-242ENST00000640577 PBRM1Q86U86 1689 aa23.38■■□□□ 1.33
SPIN3-242ENST00000640577 WDR62O43379 1518 aa23.38■■□□□ 1.33
SPIN3-242ENST00000640577 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.36■■□□□ 1.33
SPIN3-242ENST00000640577 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 TIAM1Q13009 1591 aa23.32■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.32■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 ERCC6Q03468 1493 aa23.29■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.28■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 IFT140Q96RY7 1462 aa23.27■■□□□ 1.32
SPIN3-242ENST00000640577 MAP3K1Q13233 1512 aa23.26■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 ADAMTS12P58397 1594 aa23.26■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 SAMD9Q5K651 1589 aa23.24■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 GRIN2BQ13224 1484 aa23.23■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.22■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.21■■□□□ 1.31
SPIN3-242ENST00000640577 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SPIN3-242ENST00000640577 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.18■■□□□ 1.3
SPIN3-242ENST00000640577 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.18■■□□□ 1.3
SPIN3-242ENST00000640577 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SPIN3-242ENST00000640577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.16■■□□□ 1.3
SPIN3-242ENST00000640577 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.13■■□□□ 1.29
SPIN3-242ENST00000640577 FMN1Q68DA7 1419 aa23.13■■□□□ 1.29
SPIN3-242ENST00000640577 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.12■■□□□ 1.29
SPIN3-242ENST00000640577 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.11■■□□□ 1.29
SPIN3-242ENST00000640577 IQGAP2Q13576 1575 aa23.1■■□□□ 1.29
SPIN3-242ENST00000640577 ITGAEP38570 1179 aa23.02■■□□□ 1.28
SPIN3-242ENST00000640577 GRIN2AQ12879 1464 aa23.01■■□□□ 1.27
SPIN3-242ENST00000640577 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.97■■□□□ 1.27
SPIN3-242ENST00000640577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.95■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 DISP1Q96F81 1524 aa22.91■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 SYNJ2O15056 1496 aa22.91■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.9■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 CEP170Q5SW79 1584 aa22.9■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.9■■□□□ 1.26
SPIN3-242ENST00000640577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 KIAA0556O60303 1618 aa22.87■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 FBLN2P98095 1184 aa22.86■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 HECW1Q76N89 1606 aa22.85■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 NCOA2Q15596 1464 aa22.84■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.83■■□□□ 1.25
SPIN3-242ENST00000640577 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.83■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.82■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.81■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 ARID3CA6NKF2 412 aa22.81■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 NUP160Q12769 1436 aa22.78■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 ARHGEF11O15085 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SPIN3-242ENST00000640577 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.76■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.75■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.75■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 PTPRKQ15262 1439 aa22.72■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.71■■□□□ 1.23
SPIN3-242ENST00000640577 JPH4Q96JJ6 628 aa22.69■■□□□ 1.22
SPIN3-242ENST00000640577 MAPKBP1O60336 1514 aa22.68■■□□□ 1.22
SPIN3-242ENST00000640577 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.67■■□□□ 1.22
SPIN3-242ENST00000640577 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.66■■□□□ 1.22
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SPIN3-242ENST00000640577 CHD1O14646 1710 aa22.61■■□□□ 1.21
SPIN3-242ENST00000640577 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPIN3-242ENST00000640577 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
SPIN3-242ENST00000640577 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPIN3-242ENST00000640577 HFM1A2PYH4 1435 aa22.55■■□□□ 1.2
SPIN3-242ENST00000640577 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPIN3-242ENST00000640577 NAIPQ13075 1403 aa22.53■■□□□ 1.2
SPIN3-242ENST00000640577 MIA2Q96PC5 1412 aa22.51■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 ABCA8O94911 1581 aa22.5■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 KIF14Q15058 1648 aa22.47■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPIN3-242ENST00000640577 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.45■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 KDM6BO15054 1643 aa22.42■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 SHROOM2Q13796 1616 aa22.41■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.41■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.41■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 NEUROD1Q13562 356 aa22.41■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 UACAQ9BZF9 1416 aa22.41■■□□□ 1.18
SPIN3-242ENST00000640577 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.39■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 DAPK1P53355 1430 aa22.37■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 ABCC5O15440 1437 aa22.36■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 AKNAQ7Z591 1439 aa22.35■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.34■■□□□ 1.17
SPIN3-242ENST00000640577 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.32■■□□□ 1.16
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