RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 KDM6BO15054 1643 aa15.74■□□□□ 0.11
HLA-B-257ENST00000640094 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HLA-B-257ENST00000640094 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.73■□□□□ 0.11
HLA-B-257ENST00000640094 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.7■□□□□ 0.1
HLA-B-257ENST00000640094 TSPOAP1O95153 1857 aa15.65■□□□□ 0.1
HLA-B-257ENST00000640094 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
HLA-B-257ENST00000640094 CUL7Q14999 1698 aa15.63■□□□□ 0.09
HLA-B-257ENST00000640094 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.62■□□□□ 0.09
HLA-B-257ENST00000640094 JPH4Q96JJ6 628 aa15.61■□□□□ 0.09
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.56■□□□□ 0.08
HLA-B-257ENST00000640094 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HLA-B-257ENST00000640094 GLI2P10070 1586 aa15.49■□□□□ 0.07
HLA-B-257ENST00000640094 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.49■□□□□ 0.07
HLA-B-257ENST00000640094 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HLA-B-257ENST00000640094 ABCC2Q92887 1545 aa15.48■□□□□ 0.07
HLA-B-257ENST00000640094 ADGRL1O94910 1474 aa15.46■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.46■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 KIF27Q86VH2 1401 aa15.45■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 IQGAP2Q13576 1575 aa15.45■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.44■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.43■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 PTPRGP23470 1445 aa15.43■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 ASXL2Q76L83 1435 aa15.42■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.41■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.4■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.4■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.4■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HLA-B-257ENST00000640094 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HLA-B-257ENST00000640094 IGF1RP08069 1367 aa15.36■□□□□ 0.05
HLA-B-257ENST00000640094 UACAQ9BZF9 1416 aa15.34■□□□□ 0.05
HLA-B-257ENST00000640094 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
HLA-B-257ENST00000640094 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.33■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA0556O60303 1618 aa15.31■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.3■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.3■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 DISP1Q96F81 1524 aa15.3■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.29■□□□□ 0.04
HLA-B-257ENST00000640094 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.27■□□□□ 0.03
HLA-B-257ENST00000640094 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.27■□□□□ 0.03
HLA-B-257ENST00000640094 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HLA-B-257ENST00000640094 KIF21BO75037 1637 aa15.21■□□□□ 0.03
HLA-B-257ENST00000640094 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.2■□□□□ 0.02
HLA-B-257ENST00000640094 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.2■□□□□ 0.02
HLA-B-257ENST00000640094 GOLGA3Q08378 1498 aa15.16■□□□□ 0.02
HLA-B-257ENST00000640094 ABCA8O94911 1581 aa15.15■□□□□ 0.02
HLA-B-257ENST00000640094 CD109Q6YHK3 1445 aa15.14■□□□□ 0.01
HLA-B-257ENST00000640094 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.08■□□□□ 0.01
HLA-B-257ENST00000640094 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.08■□□□□ 0
HLA-B-257ENST00000640094 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.07■□□□□ 0
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO41Q8TF61 875 aa15.05■□□□□ -0
HLA-B-257ENST00000640094 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.04■□□□□ -0
HLA-B-257ENST00000640094 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HLA-B-257ENST00000640094 PTPRMP28827 1452 aa15.03■□□□□ -0
HLA-B-257ENST00000640094 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.01□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 MADDQ8WXG6 1647 aa15.01□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 KCNH8Q96L42 1107 aa14.99□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.98□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 NEO1Q92859 1461 aa14.98□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.98□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.96□□□□□ -0.01
HLA-B-257ENST00000640094 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.95□□□□□ -0.02
HLA-B-257ENST00000640094 RICTORQ6R327 1708 aa14.94□□□□□ -0.02
HLA-B-257ENST00000640094 SAMD9Q5K651 1589 aa14.94□□□□□ -0.02
HLA-B-257ENST00000640094 PRXQ9BXM0 1461 aa14.93□□□□□ -0.02
HLA-B-257ENST00000640094 ATP10BO94823 1461 aa14.92□□□□□ -0.02
HLA-B-257ENST00000640094 FANCAO15360 1455 aa14.89□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.88□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.87□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.87□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.86□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.84□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 ARID3CA6NKF2 412 aa14.84□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 RAPGEF3O95398 923 aa14.84□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.84□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
HLA-B-257ENST00000640094 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.83□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 AKNAQ7Z591 1439 aa14.83□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.8□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 P3H3Q8IVL6 736 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 HECW1Q76N89 1606 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 HSPA2P54652 639 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-257ENST00000640094 CERKQ8TCT0 537 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.68□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.68□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.68□□□□□ -0.06
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