RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616511.4

RCAN3-209, Transcript of RCAN family member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RCAN3, Length 2,527 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3-209ENST00000616511 PBRM1Q86U86 1689 aa27.32■■□□□ 1.96
RCAN3-209ENST00000616511 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.31■■□□□ 1.96
RCAN3-209ENST00000616511 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.29■■□□□ 1.96
RCAN3-209ENST00000616511 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
RCAN3-209ENST00000616511 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RCAN3-209ENST00000616511 IFT140Q96RY7 1462 aa27.2■■□□□ 1.95
RCAN3-209ENST00000616511 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RCAN3-209ENST00000616511 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RCAN3-209ENST00000616511 ADAMTS12P58397 1594 aa27.16■■□□□ 1.94
RCAN3-209ENST00000616511 GRIN2BQ13224 1484 aa27.14■■□□□ 1.94
RCAN3-209ENST00000616511 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RCAN3-209ENST00000616511 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
RCAN3-209ENST00000616511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.12■■□□□ 1.93
RCAN3-209ENST00000616511 TIAM1Q13009 1591 aa27.09■■□□□ 1.93
RCAN3-209ENST00000616511 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.08■■□□□ 1.93
RCAN3-209ENST00000616511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.08■■□□□ 1.92
RCAN3-209ENST00000616511 SAMD9Q5K651 1589 aa27.04■■□□□ 1.92
RCAN3-209ENST00000616511 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
RCAN3-209ENST00000616511 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.97■■□□□ 1.91
RCAN3-209ENST00000616511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.96■■□□□ 1.91
RCAN3-209ENST00000616511 IQGAP2Q13576 1575 aa26.95■■□□□ 1.91
RCAN3-209ENST00000616511 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.94■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.94■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.94■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 FBLN2P98095 1184 aa26.92■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 MAP3K1Q13233 1512 aa26.91■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 ITGAEP38570 1179 aa26.9■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 GRIN2AQ12879 1464 aa26.9■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 FMN1Q68DA7 1419 aa26.9■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.89■■□□□ 1.9
RCAN3-209ENST00000616511 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.86■■□□□ 1.89
RCAN3-209ENST00000616511 ARID3CA6NKF2 412 aa26.84■■□□□ 1.89
RCAN3-209ENST00000616511 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
RCAN3-209ENST00000616511 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RCAN3-209ENST00000616511 CEP170Q5SW79 1584 aa26.79■■□□□ 1.88
RCAN3-209ENST00000616511 SYNJ2O15056 1496 aa26.77■■□□□ 1.88
RCAN3-209ENST00000616511 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.77■■□□□ 1.88
RCAN3-209ENST00000616511 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.75■■□□□ 1.87
RCAN3-209ENST00000616511 DISP1Q96F81 1524 aa26.74■■□□□ 1.87
RCAN3-209ENST00000616511 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RCAN3-209ENST00000616511 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.7■■□□□ 1.87
RCAN3-209ENST00000616511 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.7■■□□□ 1.86
RCAN3-209ENST00000616511 KIAA0556O60303 1618 aa26.7■■□□□ 1.86
RCAN3-209ENST00000616511 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RCAN3-209ENST00000616511 NUP160Q12769 1436 aa26.61■■□□□ 1.85
RCAN3-209ENST00000616511 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
RCAN3-209ENST00000616511 HECW1Q76N89 1606 aa26.6■■□□□ 1.85
RCAN3-209ENST00000616511 NCOA2Q15596 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
RCAN3-209ENST00000616511 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 JPH4Q96JJ6 628 aa26.56■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.54■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 CHD1O14646 1710 aa26.52■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.52■■□□□ 1.84
RCAN3-209ENST00000616511 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RCAN3-209ENST00000616511 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.51■■□□□ 1.83
RCAN3-209ENST00000616511 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.51■■□□□ 1.83
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RCAN3-209ENST00000616511 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.48■■□□□ 1.83
RCAN3-209ENST00000616511 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.45■■□□□ 1.82
RCAN3-209ENST00000616511 PTPRKQ15262 1439 aa26.44■■□□□ 1.82
RCAN3-209ENST00000616511 ARHGEF11O15085 1522 aa26.43■■□□□ 1.82
RCAN3-209ENST00000616511 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.39■■□□□ 1.82
RCAN3-209ENST00000616511 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
RCAN3-209ENST00000616511 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.36■■□□□ 1.81
RCAN3-209ENST00000616511 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RCAN3-209ENST00000616511 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
RCAN3-209ENST00000616511 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.29■■□□□ 1.8
RCAN3-209ENST00000616511 MAPKBP1O60336 1514 aa26.29■■□□□ 1.8
RCAN3-209ENST00000616511 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.28■■□□□ 1.8
RCAN3-209ENST00000616511 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RCAN3-209ENST00000616511 KIF14Q15058 1648 aa26.24■■□□□ 1.79
RCAN3-209ENST00000616511 ABCA8O94911 1581 aa26.24■■□□□ 1.79
RCAN3-209ENST00000616511 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.21■■□□□ 1.79
RCAN3-209ENST00000616511 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.19■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 PTPRGP23470 1445 aa26.19■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 ATP10BO94823 1461 aa26.18■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 NAIPQ13075 1403 aa26.17■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.16■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 SHROOM2Q13796 1616 aa26.16■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 HFM1A2PYH4 1435 aa26.16■■□□□ 1.78
RCAN3-209ENST00000616511 MIA2Q96PC5 1412 aa26.13■■□□□ 1.77
RCAN3-209ENST00000616511 KDM6BO15054 1643 aa26.12■■□□□ 1.77
RCAN3-209ENST00000616511 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RCAN3-209ENST00000616511 NEUROD1Q13562 356 aa26.11■■□□□ 1.77
RCAN3-209ENST00000616511 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RCAN3-209ENST00000616511 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.06■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.05■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.05■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RCAN3-209ENST00000616511 DAPK1P53355 1430 aa26.03■■□□□ 1.76
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