RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615008.4

TMEM230-211, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TMEM230, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-211ENST00000615008 EEA1Q15075 1411 aa21.89■■□□□ 1.1
TMEM230-211ENST00000615008 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 JPH4Q96JJ6 628 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 SHROOM2Q13796 1616 aa21.87■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.86■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TMEM230-211ENST00000615008 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.82■■□□□ 1.08
TMEM230-211ENST00000615008 IQGAP2Q13576 1575 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM230-211ENST00000615008 PRXQ9BXM0 1461 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM230-211ENST00000615008 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.75■■□□□ 1.07
TMEM230-211ENST00000615008 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.73■■□□□ 1.07
TMEM230-211ENST00000615008 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TMEM230-211ENST00000615008 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.65■■□□□ 1.06
TMEM230-211ENST00000615008 KIF21BO75037 1637 aa21.63■■□□□ 1.05
TMEM230-211ENST00000615008 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.63■■□□□ 1.05
TMEM230-211ENST00000615008 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.61■■□□□ 1.05
TMEM230-211ENST00000615008 PTPRGP23470 1445 aa21.6■■□□□ 1.05
TMEM230-211ENST00000615008 GOLGA3Q08378 1498 aa21.59■■□□□ 1.05
TMEM230-211ENST00000615008 KIAA0556O60303 1618 aa21.58■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 DISP1Q96F81 1524 aa21.57■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TMEM230-211ENST00000615008 P3H3Q8IVL6 736 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM230-211ENST00000615008 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM230-211ENST00000615008 UACAQ9BZF9 1416 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM230-211ENST00000615008 SAMD9Q5K651 1589 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC2Q92887 1545 aa21.39■■□□□ 1.02
TMEM230-211ENST00000615008 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
TMEM230-211ENST00000615008 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.36■■□□□ 1.01
TMEM230-211ENST00000615008 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.35■■□□□ 1.01
TMEM230-211ENST00000615008 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.34■■□□□ 1.01
TMEM230-211ENST00000615008 MAPKBP1O60336 1514 aa21.34■■□□□ 1.01
TMEM230-211ENST00000615008 ABCA8O94911 1581 aa21.3■■□□□ 1
TMEM230-211ENST00000615008 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TMEM230-211ENST00000615008 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.27■■□□□ 1
TMEM230-211ENST00000615008 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.27■■□□□ 1
TMEM230-211ENST00000615008 ARID3CA6NKF2 412 aa21.26■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.26■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 ASXL2Q76L83 1435 aa21.25■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.24■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.22■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.22■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 DIP2BQ9P265 1576 aa21.21■□□□□ 0.99
TMEM230-211ENST00000615008 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
TMEM230-211ENST00000615008 FMN1Q68DA7 1419 aa21.2■□□□□ 0.98
TMEM230-211ENST00000615008 CLIP1P30622 1438 aa21.17■□□□□ 0.98
TMEM230-211ENST00000615008 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.15■□□□□ 0.98
TMEM230-211ENST00000615008 ATP10BO94823 1461 aa21.13■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 KCNH8Q96L42 1107 aa21.12■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 TSPOAP1O95153 1857 aa21.11■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.11■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 HECW1Q76N89 1606 aa21.11■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 GLI2P10070 1586 aa21.08■□□□□ 0.97
TMEM230-211ENST00000615008 CEP162Q5TB80 1403 aa21.07■□□□□ 0.96
TMEM230-211ENST00000615008 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.05■□□□□ 0.96
TMEM230-211ENST00000615008 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TMEM230-211ENST00000615008 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.99■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.98■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.98■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.98■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 CD109Q6YHK3 1445 aa20.97■□□□□ 0.95
TMEM230-211ENST00000615008 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.95■□□□□ 0.94
TMEM230-211ENST00000615008 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.94■□□□□ 0.94
TMEM230-211ENST00000615008 KDM6BO15054 1643 aa20.93■□□□□ 0.94
TMEM230-211ENST00000615008 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
TMEM230-211ENST00000615008 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.9■□□□□ 0.94
TMEM230-211ENST00000615008 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.89■□□□□ 0.93
TMEM230-211ENST00000615008 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.88■□□□□ 0.93
TMEM230-211ENST00000615008 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TMEM230-211ENST00000615008 KIF14Q15058 1648 aa20.85■□□□□ 0.93
TMEM230-211ENST00000615008 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.92
TMEM230-211ENST00000615008 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.81■□□□□ 0.92
TMEM230-211ENST00000615008 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.8■□□□□ 0.92
TMEM230-211ENST00000615008 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.78■□□□□ 0.92
TMEM230-211ENST00000615008 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.76■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 NEO1Q92859 1461 aa20.75■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.75■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.75■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 FANCAO15360 1455 aa20.74■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 APLP2Q06481 763 aa20.72■□□□□ 0.91
TMEM230-211ENST00000615008 PLCH2O75038 1416 aa20.7■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.7■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 AKNAQ7Z591 1439 aa20.7■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.69■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.69■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.68■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 TIAM1Q13009 1591 aa20.67■□□□□ 0.9
TMEM230-211ENST00000615008 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 ADGRL1O94910 1474 aa20.64■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms