RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615008.4

TMEM230-211, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TMEM230, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-211ENST00000615008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.59■■■□□ 2.65
TMEM230-211ENST00000615008 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC9O60706 1549 aa27.51■■□□□ 1.99
TMEM230-211ENST00000615008 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM230-211ENST00000615008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
TMEM230-211ENST00000615008 NACADO15069 1562 aa26.4■■□□□ 1.82
TMEM230-211ENST00000615008 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TMEM230-211ENST00000615008 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.19■■□□□ 1.78
TMEM230-211ENST00000615008 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.1■■□□□ 1.77
TMEM230-211ENST00000615008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM230-211ENST00000615008 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
TMEM230-211ENST00000615008 SCRIBQ14160 1630 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM230-211ENST00000615008 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.55■■□□□ 1.68
TMEM230-211ENST00000615008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM230-211ENST00000615008 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM230-211ENST00000615008 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TMEM230-211ENST00000615008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.85■■□□□ 1.57
TMEM230-211ENST00000615008 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM230-211ENST00000615008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TMEM230-211ENST00000615008 SMARCA4P51532 1647 aa24.53■■□□□ 1.52
TMEM230-211ENST00000615008 SMARCA2P51531 1590 aa24.38■■□□□ 1.49
TMEM230-211ENST00000615008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.36■■□□□ 1.49
TMEM230-211ENST00000615008 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.34■■□□□ 1.49
TMEM230-211ENST00000615008 NCAPD3P42695 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
TMEM230-211ENST00000615008 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TMEM230-211ENST00000615008 HMGXB3Q12766 1538 aa24.24■■□□□ 1.47
TMEM230-211ENST00000615008 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.22■■□□□ 1.47
TMEM230-211ENST00000615008 WIZO95785 1651 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM230-211ENST00000615008 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM230-211ENST00000615008 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TMEM230-211ENST00000615008 ERCC6Q03468 1493 aa23.78■■□□□ 1.4
TMEM230-211ENST00000615008 NESP48681 1621 aa23.77■■□□□ 1.4
TMEM230-211ENST00000615008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM230-211ENST00000615008 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.65■■□□□ 1.38
TMEM230-211ENST00000615008 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
TMEM230-211ENST00000615008 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.61■■□□□ 1.37
TMEM230-211ENST00000615008 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM230-211ENST00000615008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.51■■□□□ 1.35
TMEM230-211ENST00000615008 CFTRP13569 1480 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM230-211ENST00000615008 CUX2O14529 1486 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM230-211ENST00000615008 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM230-211ENST00000615008 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM230-211ENST00000615008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TMEM230-211ENST00000615008 PRDM2Q13029 1718 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM230-211ENST00000615008 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.35■■□□□ 1.33
TMEM230-211ENST00000615008 WDR62O43379 1518 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM230-211ENST00000615008 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC8Q09428 1581 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM230-211ENST00000615008 TOPBP1Q92547 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
TMEM230-211ENST00000615008 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM230-211ENST00000615008 IFT140Q96RY7 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM230-211ENST00000615008 CUX1P39880 1505 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM230-211ENST00000615008 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TMEM230-211ENST00000615008 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM230-211ENST00000615008 SOGA1O94964 1423 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM230-211ENST00000615008 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
TMEM230-211ENST00000615008 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM230-211ENST00000615008 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM230-211ENST00000615008 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TMEM230-211ENST00000615008 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TMEM230-211ENST00000615008 TOP2BQ02880 1626 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM230-211ENST00000615008 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM230-211ENST00000615008 SYNJ1O43426 1573 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM230-211ENST00000615008 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
TMEM230-211ENST00000615008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TMEM230-211ENST00000615008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.62■■□□□ 1.21
TMEM230-211ENST00000615008 WDR97A6NE52 1622 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM230-211ENST00000615008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM230-211ENST00000615008 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 GRIN2BQ13224 1484 aa22.5■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 FBLN2P98095 1184 aa22.5■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 OSCARQ8IYS5 282 aa22.5■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.47■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 PBRM1Q86U86 1689 aa22.47■■□□□ 1.19
TMEM230-211ENST00000615008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.45■■□□□ 1.18
TMEM230-211ENST00000615008 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TMEM230-211ENST00000615008 CHD1O14646 1710 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM230-211ENST00000615008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TMEM230-211ENST00000615008 SYNJ2O15056 1496 aa22.34■■□□□ 1.17
TMEM230-211ENST00000615008 TRIM41Q8WV44 630 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM230-211ENST00000615008 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM230-211ENST00000615008 KIF27Q86VH2 1401 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM230-211ENST00000615008 ADAMTS12P58397 1594 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM230-211ENST00000615008 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM230-211ENST00000615008 GRIN2AQ12879 1464 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM230-211ENST00000615008 CUL7Q14999 1698 aa22.14■■□□□ 1.14
TMEM230-211ENST00000615008 IGF1RP08069 1367 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGEF11O15085 1522 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM230-211ENST00000615008 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM230-211ENST00000615008 CEP170Q5SW79 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM230-211ENST00000615008 NUP160Q12769 1436 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM230-211ENST00000615008 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM230-211ENST00000615008 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM230-211ENST00000615008 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM230-211ENST00000615008 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM230-211ENST00000615008 ARAP1Q96P48 1450 aa21.9■■□□□ 1.1
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