RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614198.4

GGA3-221, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 3,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-221ENST00000614198 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.3■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.28■□□□□ 0.04
GGA3-221ENST00000614198 CUL7Q14999 1698 aa15.26■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 GRIN2BQ13224 1484 aa15.25■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.24■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.24■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 ARID3CA6NKF2 412 aa15.21■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
GGA3-221ENST00000614198 ADAMTS12P58397 1594 aa15.21■□□□□ 0.02
GGA3-221ENST00000614198 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.2■□□□□ 0.02
GGA3-221ENST00000614198 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.18■□□□□ 0.02
GGA3-221ENST00000614198 APLP2Q06481 763 aa15.16■□□□□ 0.02
GGA3-221ENST00000614198 GRIN2AQ12879 1464 aa15.12■□□□□ 0.01
GGA3-221ENST00000614198 CEP170Q5SW79 1584 aa15.09■□□□□ 0.01
GGA3-221ENST00000614198 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 SYNJ2O15056 1496 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 IQGAP2Q13576 1575 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GGA3-221ENST00000614198 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 JPH4Q96JJ6 628 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 SAMD9Q5K651 1589 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 CHD1O14646 1710 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 ITGAEP38570 1179 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.99□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 DISP1Q96F81 1524 aa14.99□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 NEUROD1Q13562 356 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-221ENST00000614198 NUP160Q12769 1436 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 TIAM1Q13009 1591 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 FMN1Q68DA7 1419 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 KIAA0556O60303 1618 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-221ENST00000614198 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.89□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.84□□□□□ -0.03
GGA3-221ENST00000614198 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GGA3-221ENST00000614198 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GGA3-221ENST00000614198 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GGA3-221ENST00000614198 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.79□□□□□ -0.04
GGA3-221ENST00000614198 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.79□□□□□ -0.04
GGA3-221ENST00000614198 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 HECW1Q76N89 1606 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 MAP3K1Q13233 1512 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 PTPRGP23470 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 NCOA2Q15596 1464 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-221ENST00000614198 OSCARQ8IYS5 282 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 SHROOM2Q13796 1616 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 ATP10BO94823 1461 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 KCNH8Q96L42 1107 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.67□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 ABCA8O94911 1581 aa14.67□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 PTPRKQ15262 1439 aa14.67□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 KIF14Q15058 1648 aa14.67□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-221ENST00000614198 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.64□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 UACAQ9BZF9 1416 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 BCL11AQ9H165 835 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 ARHGEF11O15085 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.58□□□□□ -0.07
GGA3-221ENST00000614198 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 ABCC2Q92887 1545 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
GGA3-221ENST00000614198 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-221ENST00000614198 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms