RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOP2BQ02880 1626 aa27.81■■■□□ 2.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.79■■■□□ 2.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAPKBP1O60336 1514 aa27.72■■■□□ 2.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DIP2BQ9P265 1576 aa27.69■■■□□ 2.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM6BO15054 1643 aa27.67■■■□□ 2.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.67■■■□□ 2.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.66■■■□□ 2.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.61■■■□□ 2.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSPOAP1O95153 1857 aa27.52■■■□□ 2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.5■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPRGP23470 1445 aa27.41■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGF1RP08069 1367 aa27.35■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CUL7Q14999 1698 aa27.33■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF27Q86VH2 1401 aa27.32■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC2Q92887 1545 aa27.31■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.31■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASXL2Q76L83 1435 aa27.3■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRL1O94910 1474 aa27.3■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.3■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.29■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLI2P10070 1586 aa27.25■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.19■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.17■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UACAQ9BZF9 1416 aa27.16■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IQGAP2Q13576 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.13■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.12■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.07■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.05■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DISP1Q96F81 1524 aa27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.93■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.91■■□□□ 1.9
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA0556O60303 1618 aa26.88■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.87■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD109Q6YHK3 1445 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNH8Q96L42 1107 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXO41Q8TF61 875 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF21BO75037 1637 aa26.72■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GOLGA3Q08378 1498 aa26.7■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA8O94911 1581 aa26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPRMP28827 1452 aa26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARID3CA6NKF2 412 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAPGEF3O95398 923 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP10BO94823 1461 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 P3H3Q8IVL6 736 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NEO1Q92859 1461 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.41■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MADDQ8WXG6 1647 aa26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRXQ9BXM0 1461 aa26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.31■■□□□ 1.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.3■■□□□ 1.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSPA2P54652 639 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.28■■□□□ 1.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.26■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.24■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CERKQ8TCT0 537 aa26.22■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FANCAO15360 1455 aa26.21■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AKNAQ7Z591 1439 aa26.2■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SAMD9Q5K651 1589 aa26.2■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.19■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RICTORQ6R327 1708 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MLECQ14165 292 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HECW1Q76N89 1606 aa26■■□□□ 1.75
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