RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.24■■■■□ 3.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC9O60706 1549 aa36.13■■■■□ 3.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.46■■■■□ 3.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.39■■■■□ 3.1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.11■■■■□ 3.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NACADO15069 1562 aa33.71■■■□□ 2.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.57■■■□□ 2.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.56■■■□□ 2.96
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.22■■■□□ 2.91
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.05■■■□□ 2.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.01■■■□□ 2.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.62■■■□□ 2.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.61■■■□□ 2.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.57■■■□□ 2.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.35■■■□□ 2.77
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCRIBQ14160 1630 aa32.31■■■□□ 2.76
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.09■■■□□ 2.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CUX2O14529 1486 aa31.4■■■□□ 2.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERCC6Q03468 1493 aa31.31■■■□□ 2.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCAPD3P42695 1498 aa31.12■■■□□ 2.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.94■■■□□ 2.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMARCA2P51531 1590 aa30.84■■■□□ 2.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HMGXB3Q12766 1538 aa30.83■■■□□ 2.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NESP48681 1621 aa30.83■■■□□ 2.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMARCA4P51532 1647 aa30.73■■■□□ 2.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.54■■■□□ 2.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM41Q8WV44 630 aa30.52■■■□□ 2.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.43■■■□□ 2.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.41■■■□□ 2.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.39■■■□□ 2.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.21■■■□□ 2.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.18■■■□□ 2.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.17■■■□□ 2.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR62O43379 1518 aa30.08■■■□□ 2.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.94■■■□□ 2.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OSCARQ8IYS5 282 aa29.92■■■□□ 2.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.84■■■□□ 2.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WIZO95785 1651 aa29.82■■■□□ 2.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFTRP13569 1480 aa29.68■■■□□ 2.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.51■■■□□ 2.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.51■■■□□ 2.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.51■■■□□ 2.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF11O15085 1522 aa29.37■■■□□ 2.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFT140Q96RY7 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.27■■■□□ 2.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRDM2Q13029 1718 aa29.26■■■□□ 2.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOPBP1Q92547 1522 aa29.18■■■□□ 2.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC8Q09428 1581 aa29.12■■■□□ 2.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.1■■■□□ 2.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBLN2P98095 1184 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.248e-8■■□□□ 11.9
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARAP1Q96P48 1450 aa29.03■■■□□ 2.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHD1O14646 1710 aa29.02■■■□□ 2.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.76■■■□□ 2.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOGA1O94964 1423 aa28.75■■■□□ 2.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.71■■■□□ 2.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.68■■■□□ 2.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR97A6NE52 1622 aa28.62■■■□□ 2.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRIN2BQ13224 1484 aa28.55■■■□□ 2.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYNJ2O15056 1496 aa28.53■■■□□ 2.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.47■■■□□ 2.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CUX1P39880 1505 aa28.43■■■□□ 2.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PBRM1Q86U86 1689 aa28.34■■■□□ 2.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.21■■■□□ 2.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.19■■■□□ 2.1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.18■■■□□ 2.1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRIN2AQ12879 1464 aa28.17■■■□□ 2.1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP170Q5SW79 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP160Q12769 1436 aa28.08■■■□□ 2.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADAMTS12P58397 1594 aa28.04■■■□□ 2.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.99■■■□□ 2.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHROOM2Q13796 1616 aa27.99■■■□□ 2.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.94■■■□□ 2.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.88■■■□□ 2.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 JPH4Q96JJ6 628 aa27.85■■■□□ 2.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.81■■■□□ 2.04
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