RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599722.1

MED25-208, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 3

Gene MED25, Length 504 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-208	ENST00000599722	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.42	■■■■□ 3.1
MED25-208	ENST00000599722	KIF21B	O75037	1637 aa		34.39	■■■■□ 3.1
MED25-208	ENST00000599722	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MED25-208	ENST00000599722	ARAP1	Q96P48	1450 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MED25-208	ENST00000599722	SHROOM2	Q13796	1616 aa		34.32	■■■■□ 3.08
MED25-208	ENST00000599722	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.31	■■■■□ 3.08
MED25-208	ENST00000599722	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.25	■■■■□ 3.07
MED25-208	ENST00000599722	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		34.23	■■■■□ 3.07
MED25-208	ENST00000599722	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.23	■■■■□ 3.07
MED25-208	ENST00000599722	GOLGA3	Q08378	1498 aa		34.22	■■■■□ 3.07
MED25-208	ENST00000599722	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.06
MED25-208	ENST00000599722	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.1	■■■■□ 3.05
MED25-208	ENST00000599722	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		34.04	■■■■□ 3.04
MED25-208	ENST00000599722	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		34.02	■■■■□ 3.04
MED25-208	ENST00000599722	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.98	■■■■□ 3.03
MED25-208	ENST00000599722	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
MED25-208	ENST00000599722	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.94	■■■■□ 3.02
MED25-208	ENST00000599722	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.92	■■■■□ 3.02
MED25-208	ENST00000599722	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.85	■■■■□ 3.01
MED25-208	ENST00000599722	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
MED25-208	ENST00000599722	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.79	■■■■□ 3
MED25-208	ENST00000599722	PTPRG	P23470	1445 aa		33.79	■■■■□ 3
MED25-208	ENST00000599722	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
MED25-208	ENST00000599722	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.76	■■■■□ 3
MED25-208	ENST00000599722	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MED25-208	ENST00000599722	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.67	■■■□□ 2.98
MED25-208	ENST00000599722	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MED25-208	ENST00000599722	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MED25-208	ENST00000599722	CLIP1	P30622	1438 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MED25-208	ENST00000599722	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.57	■■■□□ 2.96
MED25-208	ENST00000599722	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
MED25-208	ENST00000599722	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.54	■■■□□ 2.96
MED25-208	ENST00000599722	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.51	■■■□□ 2.96
MED25-208	ENST00000599722	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.51	■■■□□ 2.95
MED25-208	ENST00000599722	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MED25-208	ENST00000599722	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.49	■■■□□ 2.95
MED25-208	ENST00000599722	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MED25-208	ENST00000599722	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MED25-208	ENST00000599722	ABCA8	O94911	1581 aa		33.36	■■■□□ 2.93
MED25-208	ENST00000599722	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.36	■■■□□ 2.93
MED25-208	ENST00000599722	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.33	■■■□□ 2.93
MED25-208	ENST00000599722	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
MED25-208	ENST00000599722	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.32	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.31	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.28	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.28	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.28	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.27	■■■□□ 2.92
MED25-208	ENST00000599722	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MED25-208	ENST00000599722	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MED25-208	ENST00000599722	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MED25-208	ENST00000599722	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MED25-208	ENST00000599722	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MED25-208	ENST00000599722	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MED25-208	ENST00000599722	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MED25-208	ENST00000599722	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MED25-208	ENST00000599722	ATP10B	O94823	1461 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	GLI2	P10070	1586 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
MED25-208	ENST00000599722	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33	■■■□□ 2.87
MED25-208	ENST00000599722	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MED25-208	ENST00000599722	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
MED25-208	ENST00000599722	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MED25-208	ENST00000599722	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MED25-208	ENST00000599722	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MED25-208	ENST00000599722	APLP2	Q06481	763 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MED25-208	ENST00000599722	KDM6B	O15054	1643 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MED25-208	ENST00000599722	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MED25-208	ENST00000599722	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MED25-208	ENST00000599722	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MED25-208	ENST00000599722	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
MED25-208	ENST00000599722	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MED25-208	ENST00000599722	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MED25-208	ENST00000599722	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.6	■■■□□ 2.81
MED25-208	ENST00000599722	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MED25-208	ENST00000599722	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MED25-208	ENST00000599722	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MED25-208	ENST00000599722	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
MED25-208	ENST00000599722	KIF14	Q15058	1648 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MED25-208	ENST00000599722	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MED25-208	ENST00000599722	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MED25-208	ENST00000599722	NEO1	Q92859	1461 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MED25-208	ENST00000599722	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MED25-208	ENST00000599722	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MED25-208	ENST00000599722	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MED25-208	ENST00000599722	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MED25-208	ENST00000599722	FANCA	O15360	1455 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MED25-208	ENST00000599722	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MED25-208	ENST00000599722	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MED25-208	ENST00000599722	PLCH2	O75038	1416 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MED25-208	ENST00000599722	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.36	■■■□□ 2.77

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