RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599722.1

MED25-208, Transcript of mediator complex subunit 25, humanhuman

TSL 3

Gene MED25, Length 504 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED25-208ENST00000599722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.44■■■■■ 5.51
MED25-208ENST00000599722 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.03■■■■■ 4.64
MED25-208ENST00000599722 ABCC9O60706 1549 aa43.12■■■■■ 4.49
MED25-208ENST00000599722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.47■■■■■ 4.23
MED25-208ENST00000599722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.47■■■■■ 4.23
MED25-208ENST00000599722 NACADO15069 1562 aa41.38■■■■■ 4.22
MED25-208ENST00000599722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
MED25-208ENST00000599722 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.05■■■■■ 4.16
MED25-208ENST00000599722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.88■■■■■ 4.13
MED25-208ENST00000599722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.54■■■■■ 4.08
MED25-208ENST00000599722 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
MED25-208ENST00000599722 SCRIBQ14160 1630 aa40.21■■■■■ 4.03
MED25-208ENST00000599722 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.14■■■■■ 4.02
MED25-208ENST00000599722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.74■■■■□ 3.95
MED25-208ENST00000599722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.49■■■■□ 3.91
MED25-208ENST00000599722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
MED25-208ENST00000599722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39■■■■□ 3.83
MED25-208ENST00000599722 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.73■■■■□ 3.79
MED25-208ENST00000599722 SMARCA4P51532 1647 aa38.41■■■■□ 3.74
MED25-208ENST00000599722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
MED25-208ENST00000599722 SMARCA2P51531 1590 aa38.18■■■■□ 3.7
MED25-208ENST00000599722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.17■■■■□ 3.7
MED25-208ENST00000599722 NCAPD3P42695 1498 aa38.13■■■■□ 3.69
MED25-208ENST00000599722 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.11■■■■□ 3.69
MED25-208ENST00000599722 HMGXB3Q12766 1538 aa37.99■■■■□ 3.67
MED25-208ENST00000599722 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.97■■■■□ 3.67
MED25-208ENST00000599722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
MED25-208ENST00000599722 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
MED25-208ENST00000599722 WIZO95785 1651 aa37.75■■■■□ 3.63
MED25-208ENST00000599722 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
MED25-208ENST00000599722 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
MED25-208ENST00000599722 NESP48681 1621 aa37.28■■■■□ 3.56
MED25-208ENST00000599722 ERCC6Q03468 1493 aa37.23■■■■□ 3.55
MED25-208ENST00000599722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.2■■■■□ 3.55
MED25-208ENST00000599722 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.05■■■■□ 3.52
MED25-208ENST00000599722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.95■■■■□ 3.51
MED25-208ENST00000599722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.9■■■■□ 3.5
MED25-208ENST00000599722 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.86■■■■□ 3.49
MED25-208ENST00000599722 CFTRP13569 1480 aa36.81■■■■□ 3.48
MED25-208ENST00000599722 CUX2O14529 1486 aa36.76■■■■□ 3.48
MED25-208ENST00000599722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
MED25-208ENST00000599722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.66■■■■□ 3.46
MED25-208ENST00000599722 PRDM2Q13029 1718 aa36.65■■■■□ 3.46
MED25-208ENST00000599722 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.64■■■■□ 3.46
MED25-208ENST00000599722 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.57■■■■□ 3.45
MED25-208ENST00000599722 WDR62O43379 1518 aa36.43■■■■□ 3.42
MED25-208ENST00000599722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
MED25-208ENST00000599722 ABCC8Q09428 1581 aa36.07■■■■□ 3.37
MED25-208ENST00000599722 TOPBP1Q92547 1522 aa36.06■■■■□ 3.36
MED25-208ENST00000599722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.04■■■■□ 3.36
MED25-208ENST00000599722 IFT140Q96RY7 1462 aa35.85■■■■□ 3.33
MED25-208ENST00000599722 CUX1P39880 1505 aa35.77■■■■□ 3.32
MED25-208ENST00000599722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
MED25-208ENST00000599722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.68■■■■□ 3.3
MED25-208ENST00000599722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
MED25-208ENST00000599722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
MED25-208ENST00000599722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
MED25-208ENST00000599722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.63■■■■□ 3.29
MED25-208ENST00000599722 SOGA1O94964 1423 aa35.62■■■■□ 3.29
MED25-208ENST00000599722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.6■■■■□ 3.29
MED25-208ENST00000599722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
MED25-208ENST00000599722 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.57■■■■□ 3.28
MED25-208ENST00000599722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.52■■■■□ 3.28
MED25-208ENST00000599722 TOP2BQ02880 1626 aa35.51■■■■□ 3.28
MED25-208ENST00000599722 SYNJ1O43426 1573 aa35.49■■■■□ 3.27
MED25-208ENST00000599722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.273e-13■■■■■ 49.2
MED25-208ENST00000599722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
MED25-208ENST00000599722 TRIM41Q8WV44 630 aa35.4■■■■□ 3.26
MED25-208ENST00000599722 WDR97A6NE52 1622 aa35.39■■■■□ 3.26
MED25-208ENST00000599722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.3■■■■□ 3.24
MED25-208ENST00000599722 OSCARQ8IYS5 282 aa35.26■■■■□ 3.24
MED25-208ENST00000599722 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
MED25-208ENST00000599722 GRIN2BQ13224 1484 aa35.21■■■■□ 3.23
MED25-208ENST00000599722 PBRM1Q86U86 1689 aa35.2■■■■□ 3.23
MED25-208ENST00000599722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.18■■■■□ 3.22
MED25-208ENST00000599722 CHD1O14646 1710 aa35.18■■■■□ 3.22
MED25-208ENST00000599722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.17■■■■□ 3.22
MED25-208ENST00000599722 FBLN2P98095 1184 aa35.16■■■■□ 3.22
MED25-208ENST00000599722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
MED25-208ENST00000599722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
MED25-208ENST00000599722 SYNJ2O15056 1496 aa34.97■■■■□ 3.19
MED25-208ENST00000599722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
MED25-208ENST00000599722 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
MED25-208ENST00000599722 EEA1Q15075 1411 aa34.85■■■■□ 3.17
MED25-208ENST00000599722 KIF27Q86VH2 1401 aa34.84■■■■□ 3.17
MED25-208ENST00000599722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.8■■■■□ 3.16
MED25-208ENST00000599722 GRIN2AQ12879 1464 aa34.75■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.74■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.71■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.7■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.7■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.7■■■■□ 3.15
MED25-208ENST00000599722 ARHGEF11O15085 1522 aa34.68■■■■□ 3.14
MED25-208ENST00000599722 CUL7Q14999 1698 aa34.63■■■■□ 3.13
MED25-208ENST00000599722 IGF1RP08069 1367 aa34.62■■■■□ 3.13
MED25-208ENST00000599722 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.6■■■■□ 3.13
MED25-208ENST00000599722 CEP170Q5SW79 1584 aa34.57■■■■□ 3.13
MED25-208ENST00000599722 NUP160Q12769 1436 aa34.55■■■■□ 3.12
MED25-208ENST00000599722 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
MED25-208ENST00000599722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.47■■■■□ 3.11
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