RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591919.5

UBXN6-207, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 1,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-207ENST00000591919 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
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UBXN6-207ENST00000591919 GRIN2AQ12879 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
UBXN6-207ENST00000591919 ARAP1Q96P48 1450 aa29.16■■■□□ 2.26
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UBXN6-207ENST00000591919 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.15■■■□□ 2.26
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UBXN6-207ENST00000591919 SAMD9Q5K651 1589 aa29.03■■■□□ 2.24
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UBXN6-207ENST00000591919 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.49■■■□□ 2.15
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UBXN6-207ENST00000591919 ABCC2Q92887 1545 aa28.14■■■□□ 2.1
UBXN6-207ENST00000591919 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.14■■■□□ 2.1
UBXN6-207ENST00000591919 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
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UBXN6-207ENST00000591919 ATP10BO94823 1461 aa28.13■■■□□ 2.09
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UBXN6-207ENST00000591919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.09■■■□□ 2.09
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UBXN6-207ENST00000591919 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN6-207ENST00000591919 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.94■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.93■■■□□ 2.06
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UBXN6-207ENST00000591919 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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UBXN6-207ENST00000591919 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-207ENST00000591919 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-207ENST00000591919 MAPKBP1O60336 1514 aa27.83■■■□□ 2.05
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UBXN6-207ENST00000591919 ITGAEP38570 1179 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 ASXL2Q76L83 1435 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 PREX2Q70Z35 1606 aa27.73■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.032e-6■■□□□ 11.5
UBXN6-207ENST00000591919 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.71■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
UBXN6-207ENST00000591919 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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