RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590699.5

CARM1-209, Transcript of coactivator associated arginine methyltransferase 1, human

TSL 5

Gene CARM1, Length 2,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARM1-209	ENST00000590699	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.61	■■■■■ 4.57
CARM1-209	ENST00000590699	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.57	■■■■■ 4.57
CARM1-209	ENST00000590699	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	43.53	■■■■■ 4.56
CARM1-209	ENST00000590699	FBLN2	P98095	1184 aa		43.52	■■■■■ 4.56
CARM1-209	ENST00000590699	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.51	■■■■■ 4.56
CARM1-209	ENST00000590699	ARAP1	Q96P48	1450 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CARM1-209	ENST00000590699	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.48	■■■■■ 4.55
CARM1-209	ENST00000590699	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CARM1-209	ENST00000590699	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CARM1-209	ENST00000590699	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.44	■■■■■ 4.54
CARM1-209	ENST00000590699	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.43	■■■■■ 4.54
CARM1-209	ENST00000590699	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
CARM1-209	ENST00000590699	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CARM1-209	ENST00000590699	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CARM1-209	ENST00000590699	CHD1	O14646	1710 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CARM1-209	ENST00000590699	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CARM1-209	ENST00000590699	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CARM1-209	ENST00000590699	APLP2	Q06481	763 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CARM1-209	ENST00000590699	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CARM1-209	ENST00000590699	NUP160	Q12769	1436 aa		43.13	■■■■■ 4.49
CARM1-209	ENST00000590699	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CARM1-209	ENST00000590699	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
CARM1-209	ENST00000590699	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CARM1-209	ENST00000590699	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
CARM1-209	ENST00000590699	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.88	■■■■■ 4.46
CARM1-209	ENST00000590699	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CARM1-209	ENST00000590699	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CARM1-209	ENST00000590699	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.44
CARM1-209	ENST00000590699	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CARM1-209	ENST00000590699	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CARM1-209	ENST00000590699	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CARM1-209	ENST00000590699	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CARM1-209	ENST00000590699	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CARM1-209	ENST00000590699	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CARM1-209	ENST00000590699	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CARM1-209	ENST00000590699	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CARM1-209	ENST00000590699	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CARM1-209	ENST00000590699	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
CARM1-209	ENST00000590699	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CARM1-209	ENST00000590699	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CARM1-209	ENST00000590699	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CARM1-209	ENST00000590699	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CARM1-209	ENST00000590699	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CARM1-209	ENST00000590699	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CARM1-209	ENST00000590699	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CARM1-209	ENST00000590699	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CARM1-209	ENST00000590699	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CARM1-209	ENST00000590699	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CARM1-209	ENST00000590699	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CARM1-209	ENST00000590699	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CARM1-209	ENST00000590699	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
CARM1-209	ENST00000590699	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CARM1-209	ENST00000590699	PTPRG	P23470	1445 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CARM1-209	ENST00000590699	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
CARM1-209	ENST00000590699	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
CARM1-209	ENST00000590699	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CARM1-209	ENST00000590699	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CARM1-209	ENST00000590699	ABCA8	O94911	1581 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CARM1-209	ENST00000590699	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CARM1-209	ENST00000590699	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CARM1-209	ENST00000590699	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CARM1-209	ENST00000590699	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
CARM1-209	ENST00000590699	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CARM1-209	ENST00000590699	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
CARM1-209	ENST00000590699	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CARM1-209	ENST00000590699	ATP10B	O94823	1461 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CARM1-209	ENST00000590699	ITGAE	P38570	1179 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CARM1-209	ENST00000590699	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
CARM1-209	ENST00000590699	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.87	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.83	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CARM1-209	ENST00000590699	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.76	■■■■■ 4.28
CARM1-209	ENST00000590699	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CARM1-209	ENST00000590699	KIF14	Q15058	1648 aa		41.7	■■■■■ 4.27
CARM1-209	ENST00000590699	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
CARM1-209	ENST00000590699	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.65	■■■■■ 4.26
CARM1-209	ENST00000590699	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.65	■■■■■ 4.26
CARM1-209	ENST00000590699	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.65	■■■■■ 4.26
CARM1-209	ENST00000590699	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.63	■■■■■ 4.25
CARM1-209	ENST00000590699	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
CARM1-209	ENST00000590699	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.61	■■■■■ 4.25
CARM1-209	ENST00000590699	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
CARM1-209	ENST00000590699	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.58	■■■■■ 4.25	3e-8	■□□□□ 10.6
CARM1-209	ENST00000590699	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CARM1-209	ENST00000590699	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.52	■■■■■ 4.24
CARM1-209	ENST00000590699	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.51	■■■■■ 4.24
CARM1-209	ENST00000590699	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	41.47	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	41.45	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.44	■■■■■ 4.23
CARM1-209	ENST00000590699	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.42	■■■■■ 4.22
CARM1-209	ENST00000590699	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	41.41	■■■■■ 4.22
CARM1-209	ENST00000590699	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.39	■■■■■ 4.22
CARM1-209	ENST00000590699	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.37	■■■■■ 4.21
CARM1-209	ENST00000590699	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.34	■■■■■ 4.21

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