RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590699.5

CARM1-209, Transcript of coactivator associated arginine methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CARM1, Length 2,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1-209ENST00000590699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.98■■■■■ 7.67
CARM1-209ENST00000590699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55■■■■■ 6.39
CARM1-209ENST00000590699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.83■■■■■ 6.05
CARM1-209ENST00000590699 ABCC9O60706 1549 aa52.61■■■■■ 6.01
CARM1-209ENST00000590699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.52■■■■■ 6
CARM1-209ENST00000590699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.91■■■■■ 5.9
CARM1-209ENST00000590699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.62■■■■■ 5.85
CARM1-209ENST00000590699 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.45■■■■■ 5.83
CARM1-209ENST00000590699 NACADO15069 1562 aa51.35■■■■■ 5.81
CARM1-209ENST00000590699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.05■■■■■ 5.76
CARM1-209ENST00000590699 SCRIBQ14160 1630 aa50.7■■■■■ 5.71
CARM1-209ENST00000590699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.1■■■■■ 5.61
CARM1-209ENST00000590699 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.59■■■■■ 5.53
CARM1-209ENST00000590699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
CARM1-209ENST00000590699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.58■■■■■ 5.53
CARM1-209ENST00000590699 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.09■■■■■ 5.45
CARM1-209ENST00000590699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
CARM1-209ENST00000590699 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.74■■■■■ 5.39
CARM1-209ENST00000590699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
CARM1-209ENST00000590699 SMARCA4P51532 1647 aa48.45■■■■■ 5.35
CARM1-209ENST00000590699 WIZO95785 1651 aa48.36■■■■■ 5.33
CARM1-209ENST00000590699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
CARM1-209ENST00000590699 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.83■■■■■ 5.25
CARM1-209ENST00000590699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.79■■■■■ 5.24
CARM1-209ENST00000590699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
CARM1-209ENST00000590699 SMARCA2P51531 1590 aa47.7■■■■■ 5.23
CARM1-209ENST00000590699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.56■■■■■ 5.2
CARM1-209ENST00000590699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
CARM1-209ENST00000590699 NCAPD3P42695 1498 aa47.43■■■■■ 5.18
CARM1-209ENST00000590699 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.33■■■■■ 5.17
CARM1-209ENST00000590699 HMGXB3Q12766 1538 aa47.29■■■■■ 5.16
CARM1-209ENST00000590699 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.2■■■■■ 5.15
CARM1-209ENST00000590699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.95■■■■■ 5.11
CARM1-209ENST00000590699 TRIM41Q8WV44 630 aa46.51■■■■■ 5.04
CARM1-209ENST00000590699 ABCC8Q09428 1581 aa46.37■■■■■ 5.01
CARM1-209ENST00000590699 CFTRP13569 1480 aa46.26■■■■■ 5
CARM1-209ENST00000590699 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.21■■■■■ 4.99
CARM1-209ENST00000590699 NESP48681 1621 aa46.06■■■■■ 4.96
CARM1-209ENST00000590699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46■■■■■ 4.95
CARM1-209ENST00000590699 PRDM2Q13029 1718 aa45.95■■■■■ 4.95
CARM1-209ENST00000590699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.88■■■■■ 4.93
CARM1-209ENST00000590699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
CARM1-209ENST00000590699 SYNJ1O43426 1573 aa45.82■■■■■ 4.93
CARM1-209ENST00000590699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.71■■■■■ 4.91
CARM1-209ENST00000590699 TOP2BQ02880 1626 aa45.56■■■■■ 4.88
CARM1-209ENST00000590699 CUX1P39880 1505 aa45.56■■■■■ 4.88
CARM1-209ENST00000590699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.55■■■■■ 4.88
CARM1-209ENST00000590699 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.55■■■■■ 4.88
CARM1-209ENST00000590699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.48■■■■■ 4.87
CARM1-209ENST00000590699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.46■■■■■ 4.87
CARM1-209ENST00000590699 SOGA1O94964 1423 aa45.45■■■■■ 4.87
CARM1-209ENST00000590699 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.45■■■■■ 4.87
CARM1-209ENST00000590699 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.36■■■■■ 4.85
CARM1-209ENST00000590699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.32■■■■■ 4.85
CARM1-209ENST00000590699 HRCP23327 699 aa45.28■■■■■ 4.84
CARM1-209ENST00000590699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.83
CARM1-209ENST00000590699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.17■■■■■ 4.82
CARM1-209ENST00000590699 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.17■■■■■ 4.82
CARM1-209ENST00000590699 TOPBP1Q92547 1522 aa45.16■■■■■ 4.82
CARM1-209ENST00000590699 ERCC6Q03468 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
CARM1-209ENST00000590699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.11■■■■■ 4.81
CARM1-209ENST00000590699 EEA1Q15075 1411 aa45.1■■■■■ 4.81
CARM1-209ENST00000590699 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.08■■■■■ 4.81
CARM1-209ENST00000590699 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.01■■■■■ 4.8
CARM1-209ENST00000590699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
CARM1-209ENST00000590699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.85■■■■■ 4.77
CARM1-209ENST00000590699 KIF27Q86VH2 1401 aa44.83■■■■■ 4.77
CARM1-209ENST00000590699 CUX2O14529 1486 aa44.82■■■■■ 4.77
CARM1-209ENST00000590699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
CARM1-209ENST00000590699 WDR62O43379 1518 aa44.79■■■■■ 4.76
CARM1-209ENST00000590699 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
CARM1-209ENST00000590699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.62■■■■■ 4.73
CARM1-209ENST00000590699 GOLGA3Q08378 1498 aa44.58■■■■■ 4.73
CARM1-209ENST00000590699 KIF21BO75037 1637 aa44.56■■■■■ 4.72
CARM1-209ENST00000590699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
CARM1-209ENST00000590699 WDR97A6NE52 1622 aa44.51■■■■■ 4.72
CARM1-209ENST00000590699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.5■■■■■ 4.71
CARM1-209ENST00000590699 IGF1RP08069 1367 aa44.48■■■■■ 4.71
CARM1-209ENST00000590699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
CARM1-209ENST00000590699 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
CARM1-209ENST00000590699 PRXQ9BXM0 1461 aa44.44■■■■■ 4.7
CARM1-209ENST00000590699 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.4■■■■■ 4.7
CARM1-209ENST00000590699 IFT140Q96RY7 1462 aa44.37■■■■■ 4.69
CARM1-209ENST00000590699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.29■■■■■ 4.68
CARM1-209ENST00000590699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.28■■■■■ 4.68
CARM1-209ENST00000590699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.28■■■■■ 4.68
CARM1-209ENST00000590699 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.27■■■■■ 4.68
CARM1-209ENST00000590699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
CARM1-209ENST00000590699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.23■■■■■ 4.675e-8■■■■□ 25.9
CARM1-209ENST00000590699 CEP162Q5TB80 1403 aa44.22■■■■■ 4.67
CARM1-209ENST00000590699 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
CARM1-209ENST00000590699 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
CARM1-209ENST00000590699 CUL7Q14999 1698 aa44.04■■■■■ 4.64
CARM1-209ENST00000590699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
CARM1-209ENST00000590699 PBRM1Q86U86 1689 aa44.03■■■■■ 4.64
CARM1-209ENST00000590699 GRIN2BQ13224 1484 aa43.95■■■■■ 4.63
CARM1-209ENST00000590699 CLIP1P30622 1438 aa43.92■■■■■ 4.62
CARM1-209ENST00000590699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.76■■■■■ 4.6
CARM1-209ENST00000590699 ADAMTS12P58397 1594 aa43.75■■■■■ 4.59
CARM1-209ENST00000590699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.74■■■■■ 4.59
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