RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589627.1

VASP-208, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene VASP, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASP-208ENST00000589627 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
VASP-208ENST00000589627 JPH4Q96JJ6 628 aa41.16■■■■■ 4.18
VASP-208ENST00000589627 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.1■■■■■ 4.17
VASP-208ENST00000589627 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.02■■■■■ 4.16
VASP-208ENST00000589627 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.83■■■■■ 4.13
VASP-208ENST00000589627 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.82■■■■■ 4.13
VASP-208ENST00000589627 IQGAP2Q13576 1575 aa40.81■■■■■ 4.12
VASP-208ENST00000589627 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.74■■■■■ 4.11
VASP-208ENST00000589627 MAPKBP1O60336 1514 aa40.71■■■■■ 4.11
VASP-208ENST00000589627 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.63■■■■■ 4.09
VASP-208ENST00000589627 PTPRGP23470 1445 aa40.58■■■■■ 4.09
VASP-208ENST00000589627 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.57■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.57■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 DISP1Q96F81 1524 aa40.57■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.57■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.56■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 DIP2BQ9P265 1576 aa40.55■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
VASP-208ENST00000589627 KIAA0556O60303 1618 aa40.45■■■■■ 4.07
VASP-208ENST00000589627 PRXQ9BXM0 1461 aa40.44■■■■■ 4.06
VASP-208ENST00000589627 ABCC2Q92887 1545 aa40.42■■■■■ 4.06
VASP-208ENST00000589627 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.41■■■■■ 4.06
VASP-208ENST00000589627 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.37■■■■■ 4.05
VASP-208ENST00000589627 UACAQ9BZF9 1416 aa40.33■■■■■ 4.05
VASP-208ENST00000589627 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
VASP-208ENST00000589627 TSPOAP1O95153 1857 aa40.24■■■■■ 4.03
VASP-208ENST00000589627 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.22■■■■■ 4.03
VASP-208ENST00000589627 GOLGA3Q08378 1498 aa40.2■■■■■ 4.03
VASP-208ENST00000589627 ASXL2Q76L83 1435 aa40.2■■■■■ 4.03
VASP-208ENST00000589627 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.19■■■■■ 4.03
VASP-208ENST00000589627 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
VASP-208ENST00000589627 GLI2P10070 1586 aa40.17■■■■■ 4.02
VASP-208ENST00000589627 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
VASP-208ENST00000589627 EEA1Q15075 1411 aa40.08■■■■■ 4.01
VASP-208ENST00000589627 KDM6BO15054 1643 aa40.07■■■■■ 4.01
VASP-208ENST00000589627 ABCA8O94911 1581 aa40.06■■■■■ 4
VASP-208ENST00000589627 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.06■■■■■ 4
VASP-208ENST00000589627 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
VASP-208ENST00000589627 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.98■■■■□ 3.99
VASP-208ENST00000589627 SAMD9Q5K651 1589 aa39.96■■■■□ 3.99
VASP-208ENST00000589627 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.89■■■■□ 3.98
VASP-208ENST00000589627 KIF21BO75037 1637 aa39.83■■■■□ 3.97
VASP-208ENST00000589627 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
VASP-208ENST00000589627 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.74■■■■□ 3.95
VASP-208ENST00000589627 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.74■■■■□ 3.95
VASP-208ENST00000589627 P3H3Q8IVL6 736 aa39.7■■■■□ 3.95
VASP-208ENST00000589627 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.69■■■■□ 3.94
VASP-208ENST00000589627 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
VASP-208ENST00000589627 ATP10BO94823 1461 aa39.64■■■■□ 3.94
VASP-208ENST00000589627 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
VASP-208ENST00000589627 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.61■■■■□ 3.93
VASP-208ENST00000589627 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.6■■■■□ 3.93
VASP-208ENST00000589627 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.57■■■■□ 3.93
VASP-208ENST00000589627 CD109Q6YHK3 1445 aa39.56■■■■□ 3.92
VASP-208ENST00000589627 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.55■■■■□ 3.92
VASP-208ENST00000589627 KCNH8Q96L42 1107 aa39.51■■■■□ 3.92
VASP-208ENST00000589627 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
VASP-208ENST00000589627 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.48■■■■□ 3.91
VASP-208ENST00000589627 ARID3CA6NKF2 412 aa39.46■■■■□ 3.91
VASP-208ENST00000589627 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
VASP-208ENST00000589627 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.4■■■■□ 3.9
VASP-208ENST00000589627 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.3■■■■□ 3.88
VASP-208ENST00000589627 ADGRL1O94910 1474 aa39.24■■■■□ 3.87
VASP-208ENST00000589627 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
VASP-208ENST00000589627 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
VASP-208ENST00000589627 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
VASP-208ENST00000589627 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.22■■■■□ 3.87
VASP-208ENST00000589627 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.19■■■■□ 3.86
VASP-208ENST00000589627 NEO1Q92859 1461 aa39.17■■■■□ 3.86
VASP-208ENST00000589627 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.16■■■■□ 3.86
VASP-208ENST00000589627 FMN1Q68DA7 1419 aa39.14■■■■□ 3.86
VASP-208ENST00000589627 HECW1Q76N89 1606 aa39.13■■■■□ 3.85
VASP-208ENST00000589627 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
VASP-208ENST00000589627 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.852e-10■■■□□ 15.1
VASP-208ENST00000589627 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.1■■■■□ 3.85
VASP-208ENST00000589627 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.08■■■■□ 3.85
VASP-208ENST00000589627 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.06■■■■□ 3.84
VASP-208ENST00000589627 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.03■■■■□ 3.84
VASP-208ENST00000589627 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39■■■■□ 3.83
VASP-208ENST00000589627 RICTORQ6R327 1708 aa38.96■■■■□ 3.83
VASP-208ENST00000589627 FANCAO15360 1455 aa38.92■■■■□ 3.82
VASP-208ENST00000589627 RAPGEF3O95398 923 aa38.91■■■■□ 3.82
VASP-208ENST00000589627 AKNAQ7Z591 1439 aa38.89■■■■□ 3.82
VASP-208ENST00000589627 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.86■■■■□ 3.81
VASP-208ENST00000589627 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
VASP-208ENST00000589627 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
VASP-208ENST00000589627 KIF14Q15058 1648 aa38.83■■■■□ 3.81
VASP-208ENST00000589627 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.82■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 PLCH2O75038 1416 aa38.8■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.79■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.78■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.77■■■■□ 3.8
VASP-208ENST00000589627 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
VASP-208ENST00000589627 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.73■■■■□ 3.79
VASP-208ENST00000589627 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.72■■■■□ 3.79
VASP-208ENST00000589627 CLIP1P30622 1438 aa38.68■■■■□ 3.78
VASP-208ENST00000589627 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.66■■■■□ 3.78
VASP-208ENST00000589627 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.65■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms