RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 JPH4Q96JJ6 628 aa23.15■■□□□ 1.3
CTIF-207ENST00000589585 SHROOM2Q13796 1616 aa23.15■■□□□ 1.3
CTIF-207ENST00000589585 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
CTIF-207ENST00000589585 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.07■■□□□ 1.28
CTIF-207ENST00000589585 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.05■■□□□ 1.28
CTIF-207ENST00000589585 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.03■■□□□ 1.28
CTIF-207ENST00000589585 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.97■■□□□ 1.27
CTIF-207ENST00000589585 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTIF-207ENST00000589585 PRXQ9BXM0 1461 aa22.92■■□□□ 1.26
CTIF-207ENST00000589585 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.92■■□□□ 1.26
CTIF-207ENST00000589585 IQGAP2Q13576 1575 aa22.9■■□□□ 1.26
CTIF-207ENST00000589585 EEA1Q15075 1411 aa22.9■■□□□ 1.26
CTIF-207ENST00000589585 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CTIF-207ENST00000589585 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.86■■□□□ 1.25
CTIF-207ENST00000589585 PTPRGP23470 1445 aa22.81■■□□□ 1.24
CTIF-207ENST00000589585 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.78■■□□□ 1.24
CTIF-207ENST00000589585 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-207ENST00000589585 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-207ENST00000589585 DISP1Q96F81 1524 aa22.76■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.74■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 MAPKBP1O60336 1514 aa22.72■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.71■■□□□ 1.23
CTIF-207ENST00000589585 DIP2BQ9P265 1576 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-207ENST00000589585 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-207ENST00000589585 KIAA0556O60303 1618 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-207ENST00000589585 GOLGA3Q08378 1498 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-207ENST00000589585 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTIF-207ENST00000589585 P3H3Q8IVL6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 KIF21BO75037 1637 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 UACAQ9BZF9 1416 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 TSPOAP1O95153 1857 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-207ENST00000589585 ABCC2Q92887 1545 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-207ENST00000589585 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.55■■□□□ 1.2
CTIF-207ENST00000589585 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.53■■□□□ 1.2
CTIF-207ENST00000589585 KDM6BO15054 1643 aa22.52■■□□□ 1.2
CTIF-207ENST00000589585 SAMD9Q5K651 1589 aa22.46■■□□□ 1.19
CTIF-207ENST00000589585 ASXL2Q76L83 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.45■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 ABCA8O94911 1581 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 ARID3CA6NKF2 412 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CTIF-207ENST00000589585 GLI2P10070 1586 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-207ENST00000589585 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-207ENST00000589585 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTIF-207ENST00000589585 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTIF-207ENST00000589585 KCNH8Q96L42 1107 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 ATP10BO94823 1461 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTIF-207ENST00000589585 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-207ENST00000589585 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTIF-207ENST00000589585 FMN1Q68DA7 1419 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-207ENST00000589585 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 CLIP1P30622 1438 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.15■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 CD109Q6YHK3 1445 aa22.14■■□□□ 1.14
CTIF-207ENST00000589585 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-207ENST00000589585 ADGRL1O94910 1474 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-207ENST00000589585 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTIF-207ENST00000589585 HECW1Q76N89 1606 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-207ENST00000589585 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTIF-207ENST00000589585 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.05■■□□□ 1.12
CTIF-207ENST00000589585 CEP162Q5TB80 1403 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-207ENST00000589585 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-207ENST00000589585 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-207ENST00000589585 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTIF-207ENST00000589585 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.96■■□□□ 1.11
CTIF-207ENST00000589585 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.94■■□□□ 1.1
CTIF-207ENST00000589585 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CTIF-207ENST00000589585 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTIF-207ENST00000589585 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.91■■□□□ 1.1
CTIF-207ENST00000589585 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-207ENST00000589585 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.88■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 NEO1Q92859 1461 aa21.88■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.87■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.87■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 FANCAO15360 1455 aa21.85■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 RAPGEF3O95398 923 aa21.85■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 KIF14Q15058 1648 aa21.84■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 PLCH2O75038 1416 aa21.84■■□□□ 1.09
CTIF-207ENST00000589585 AKNAQ7Z591 1439 aa21.82■■□□□ 1.08
CTIF-207ENST00000589585 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.81■■□□□ 1.08
CTIF-207ENST00000589585 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.78■■□□□ 1.08
CTIF-207ENST00000589585 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.77■■□□□ 1.08
CTIF-207ENST00000589585 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.76■■□□□ 1.07
CTIF-207ENST00000589585 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTIF-207ENST00000589585 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.75■■□□□ 1.07
CTIF-207ENST00000589585 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms