RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.27■■■□□ 2.92
CTIF-207ENST00000589585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.53■■■□□ 2.32
CTIF-207ENST00000589585 ABCC9O60706 1549 aa29.45■■■□□ 2.31
CTIF-207ENST00000589585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.04■■■□□ 2.08
CTIF-207ENST00000589585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.03■■■□□ 2.08
CTIF-207ENST00000589585 NACADO15069 1562 aa27.84■■■□□ 2.05
CTIF-207ENST00000589585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTIF-207ENST00000589585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.64■■■□□ 2.02
CTIF-207ENST00000589585 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.6■■■□□ 2.01
CTIF-207ENST00000589585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.53■■■□□ 2
CTIF-207ENST00000589585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.46■■□□□ 1.99
CTIF-207ENST00000589585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CTIF-207ENST00000589585 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.24■■□□□ 1.95
CTIF-207ENST00000589585 SCRIBQ14160 1630 aa27.04■■□□□ 1.92
CTIF-207ENST00000589585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.81■■□□□ 1.88
CTIF-207ENST00000589585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.64■■□□□ 1.85
CTIF-207ENST00000589585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTIF-207ENST00000589585 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.52■■□□□ 1.84
CTIF-207ENST00000589585 SMARCA4P51532 1647 aa25.81■■□□□ 1.72
CTIF-207ENST00000589585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CTIF-207ENST00000589585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.73■■□□□ 1.71
CTIF-207ENST00000589585 NCAPD3P42695 1498 aa25.72■■□□□ 1.71
CTIF-207ENST00000589585 SMARCA2P51531 1590 aa25.67■■□□□ 1.7
CTIF-207ENST00000589585 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.65■■□□□ 1.7
CTIF-207ENST00000589585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CTIF-207ENST00000589585 HMGXB3Q12766 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
CTIF-207ENST00000589585 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.52■■□□□ 1.68
CTIF-207ENST00000589585 ERCC6Q03468 1493 aa25.42■■□□□ 1.66
CTIF-207ENST00000589585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-207ENST00000589585 CUX2O14529 1486 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-207ENST00000589585 WIZO95785 1651 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-207ENST00000589585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CTIF-207ENST00000589585 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
CTIF-207ENST00000589585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.12■■□□□ 1.61
CTIF-207ENST00000589585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTIF-207ENST00000589585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTIF-207ENST00000589585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.07■■□□□ 1.6
CTIF-207ENST00000589585 CADPSQ9ULU8 1353 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-207ENST00000589585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.93■■□□□ 1.58
CTIF-207ENST00000589585 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.83■■□□□ 1.56
CTIF-207ENST00000589585 CFTRP13569 1480 aa24.8■■□□□ 1.56
CTIF-207ENST00000589585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTIF-207ENST00000589585 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.74■■□□□ 1.55
CTIF-207ENST00000589585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.71■■□□□ 1.55
CTIF-207ENST00000589585 WDR62O43379 1518 aa24.71■■□□□ 1.55
CTIF-207ENST00000589585 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.68■■□□□ 1.54
CTIF-207ENST00000589585 PRDM2Q13029 1718 aa24.48■■□□□ 1.51
CTIF-207ENST00000589585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTIF-207ENST00000589585 TRIM41Q8WV44 630 aa24.29■■□□□ 1.48
CTIF-207ENST00000589585 TOPBP1Q92547 1522 aa24.29■■□□□ 1.48
CTIF-207ENST00000589585 ABCC8Q09428 1581 aa24.27■■□□□ 1.48
CTIF-207ENST00000589585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.22■■□□□ 1.47
CTIF-207ENST00000589585 IFT140Q96RY7 1462 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-207ENST00000589585 OSCARQ8IYS5 282 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-207ENST00000589585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTIF-207ENST00000589585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTIF-207ENST00000589585 CUX1P39880 1505 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-207ENST00000589585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CTIF-207ENST00000589585 SOGA1O94964 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-207ENST00000589585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CTIF-207ENST00000589585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
CTIF-207ENST00000589585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
CTIF-207ENST00000589585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTIF-207ENST00000589585 CHD1O14646 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
CTIF-207ENST00000589585 ARHGEF11O15085 1522 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-207ENST00000589585 SYNJ1O43426 1573 aa23.82■■□□□ 1.4
CTIF-207ENST00000589585 TOP2BQ02880 1626 aa23.81■■□□□ 1.4
CTIF-207ENST00000589585 FBLN2P98095 1184 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-207ENST00000589585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.77■■□□□ 1.4
CTIF-207ENST00000589585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-207ENST00000589585 WDR97A6NE52 1622 aa23.74■■□□□ 1.39
CTIF-207ENST00000589585 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.73■■□□□ 1.39
CTIF-207ENST00000589585 GRIN2BQ13224 1484 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-207ENST00000589585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.7■■□□□ 1.38
CTIF-207ENST00000589585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTIF-207ENST00000589585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CTIF-207ENST00000589585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-207ENST00000589585 ARAP1Q96P48 1450 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-207ENST00000589585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-207ENST00000589585 PBRM1Q86U86 1689 aa23.58■■□□□ 1.37
CTIF-207ENST00000589585 SYNJ2O15056 1496 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-207ENST00000589585 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-207ENST00000589585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-207ENST00000589585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-207ENST00000589585 KIF27Q86VH2 1401 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-207ENST00000589585 ADAMTS12P58397 1594 aa23.42■■□□□ 1.34
CTIF-207ENST00000589585 GRIN2AQ12879 1464 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-207ENST00000589585 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CTIF-207ENST00000589585 IGF1RP08069 1367 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-207ENST00000589585 NUP160Q12769 1436 aa23.29■■□□□ 1.32
CTIF-207ENST00000589585 CEP170Q5SW79 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
CTIF-207ENST00000589585 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.23■■□□□ 1.31
CTIF-207ENST00000589585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.21■■□□□ 1.31
CTIF-207ENST00000589585 CUL7Q14999 1698 aa23.2■■□□□ 1.3
CTIF-207ENST00000589585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.2■■□□□ 1.3
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