RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNJ2O15056 1496 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIN2AQ12879 1464 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMD9Q5K651 1589 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-207ENST00000589146 IQGAP2Q13576 1575 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.57■■■■□ 3.29
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP160Q12769 1436 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-207ENST00000589146 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP170Q5SW79 1584 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-207ENST00000589146 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-207ENST00000589146 APLP2Q06481 763 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 FMN1Q68DA7 1419 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K1Q13233 1512 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 P3H3Q8IVL6 736 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 FBLN2P98095 1184 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.32■■■■□ 3.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-207ENST00000589146 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CHD1O14646 1710 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-207ENST00000589146 DISP1Q96F81 1524 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0556O60303 1618 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-207ENST00000589146 TIAM1Q13009 1591 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-207ENST00000589146 JPH4Q96JJ6 628 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-207ENST00000589146 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-207ENST00000589146 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-207ENST00000589146 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-207ENST00000589146 SHROOM2Q13796 1616 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-207ENST00000589146 HECW1Q76N89 1606 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-207ENST00000589146 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-207ENST00000589146 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-207ENST00000589146 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-207ENST00000589146 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA8O94911 1581 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-207ENST00000589146 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-207ENST00000589146 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRGP23470 1445 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.7■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF11O15085 1522 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA2Q15596 1464 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-207ENST00000589146 OSCARQ8IYS5 282 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-207ENST00000589146 UACAQ9BZF9 1416 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-207ENST00000589146 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP10BO94823 1461 aa34.51■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 HRCP23327 699 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID3CA6NKF2 412 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC2Q92887 1545 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-207ENST00000589146 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.45■■■■□ 3.1
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-207ENST00000589146 MIA2Q96PC5 1412 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF14Q15058 1648 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-207ENST00000589146 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGAEP38570 1179 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-207ENST00000589146 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRKQ15262 1439 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-207ENST00000589146 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.036e-24■■□□□ 13
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 AKNAQ7Z591 1439 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 PREX2Q70Z35 1606 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-207ENST00000589146 HFM1A2PYH4 1435 aa33.95■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 DAPK1P53355 1430 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.92■■■■□ 3.02
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